Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SptssbQ925E8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SptssbQ925E8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SptssbQ925E8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SptssbQ925E8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SptssbQ925E8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SptssbQ925E8 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SptssbQ925E8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SptssbQ925E8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SptssbQ925E8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SptssbQ925E8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SptssbQ925E8 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SptssbQ925E8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SptssbQ925E8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SptssbQ925E8 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SptssbQ925E8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SptssbQ925E8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SptssbQ925E8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SptssbQ925E8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SptssbQ925E8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SptssbQ925E8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SptssbQ925E8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SptssbQ925E8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SptssbQ925E8 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SptssbQ925E8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SptssbQ925E8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SptssbQ925E8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SptssbQ925E8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SptssbQ925E8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SptssbQ925E8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SptssbQ925E8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SptssbQ925E8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SptssbQ925E8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SptssbQ925E8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SptssbQ925E8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SptssbQ925E8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SptssbQ925E8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SptssbQ925E8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SptssbQ925E8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SptssbQ925E8 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SptssbQ925E8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SptssbQ925E8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SptssbQ925E8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SptssbQ925E8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SptssbQ925E8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SptssbQ925E8 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SptssbQ925E8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SptssbQ925E8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
SptssbQ925E8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SptssbQ925E8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SptssbQ925E8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SptssbQ925E8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SptssbQ925E8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SptssbQ925E8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SptssbQ925E8 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SptssbQ925E8 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SptssbQ925E8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SptssbQ925E8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SptssbQ925E8 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SptssbQ925E8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SptssbQ925E8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SptssbQ925E8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SptssbQ925E8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SptssbQ925E8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SptssbQ925E8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SptssbQ925E8 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SptssbQ925E8 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SptssbQ925E8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SptssbQ925E8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SptssbQ925E8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SptssbQ925E8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SptssbQ925E8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SptssbQ925E8 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SptssbQ925E8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SptssbQ925E8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SptssbQ925E8 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SptssbQ925E8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SptssbQ925E8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SptssbQ925E8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SptssbQ925E8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SptssbQ925E8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SptssbQ925E8 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SptssbQ925E8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SptssbQ925E8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SptssbQ925E8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SptssbQ925E8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SptssbQ925E8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SptssbQ925E8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SptssbQ925E8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SptssbQ925E8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SptssbQ925E8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SptssbQ925E8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SptssbQ925E8 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SptssbQ925E8 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SptssbQ925E8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SptssbQ925E8 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SptssbQ925E8 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SptssbQ925E8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SptssbQ925E8 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SptssbQ925E8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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