Protein–RNA interactions for Protein: Q923T7

Trim7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim7Q923T7 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trim7Q923T7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trim7Q923T7 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trim7Q923T7 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trim7Q923T7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trim7Q923T7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trim7Q923T7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trim7Q923T7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trim7Q923T7 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trim7Q923T7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Trim7Q923T7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trim7Q923T7 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trim7Q923T7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trim7Q923T7 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trim7Q923T7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trim7Q923T7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trim7Q923T7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trim7Q923T7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trim7Q923T7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trim7Q923T7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Trim7Q923T7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trim7Q923T7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trim7Q923T7 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trim7Q923T7 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trim7Q923T7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trim7Q923T7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trim7Q923T7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trim7Q923T7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trim7Q923T7 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trim7Q923T7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trim7Q923T7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim7Q923T7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim7Q923T7 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trim7Q923T7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trim7Q923T7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Trim7Q923T7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim7Q923T7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim7Q923T7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim7Q923T7 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Trim7Q923T7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim7Q923T7 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim7Q923T7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trim7Q923T7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trim7Q923T7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trim7Q923T7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trim7Q923T7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Trim7Q923T7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trim7Q923T7 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trim7Q923T7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trim7Q923T7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim7Q923T7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim7Q923T7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim7Q923T7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim7Q923T7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim7Q923T7 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim7Q923T7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim7Q923T7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim7Q923T7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim7Q923T7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim7Q923T7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trim7Q923T7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trim7Q923T7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim7Q923T7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim7Q923T7 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim7Q923T7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim7Q923T7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim7Q923T7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim7Q923T7 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim7Q923T7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim7Q923T7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim7Q923T7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim7Q923T7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim7Q923T7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim7Q923T7 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim7Q923T7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim7Q923T7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim7Q923T7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim7Q923T7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim7Q923T7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim7Q923T7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim7Q923T7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim7Q923T7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Trim7Q923T7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim7Q923T7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim7Q923T7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim7Q923T7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim7Q923T7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trim7Q923T7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trim7Q923T7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trim7Q923T7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trim7Q923T7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trim7Q923T7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim7Q923T7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim7Q923T7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim7Q923T7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim7Q923T7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim7Q923T7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim7Q923T7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trim7Q923T7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim7Q923T7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms