Protein–RNA interactions for Protein: Q921W0

Chmp1a, Charged multivesicular body protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp1aQ921W0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chmp1aQ921W0 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chmp1aQ921W0 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chmp1aQ921W0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chmp1aQ921W0 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Chmp1aQ921W0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chmp1aQ921W0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chmp1aQ921W0 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chmp1aQ921W0 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chmp1aQ921W0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Chmp1aQ921W0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chmp1aQ921W0 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chmp1aQ921W0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chmp1aQ921W0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chmp1aQ921W0 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chmp1aQ921W0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chmp1aQ921W0 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Chmp1aQ921W0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chmp1aQ921W0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chmp1aQ921W0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chmp1aQ921W0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Chmp1aQ921W0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chmp1aQ921W0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chmp1aQ921W0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chmp1aQ921W0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chmp1aQ921W0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chmp1aQ921W0 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chmp1aQ921W0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chmp1aQ921W0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chmp1aQ921W0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chmp1aQ921W0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chmp1aQ921W0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chmp1aQ921W0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chmp1aQ921W0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Chmp1aQ921W0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chmp1aQ921W0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chmp1aQ921W0 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chmp1aQ921W0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chmp1aQ921W0 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chmp1aQ921W0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chmp1aQ921W0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chmp1aQ921W0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chmp1aQ921W0 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chmp1aQ921W0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chmp1aQ921W0 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chmp1aQ921W0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Chmp1aQ921W0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chmp1aQ921W0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chmp1aQ921W0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chmp1aQ921W0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chmp1aQ921W0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chmp1aQ921W0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chmp1aQ921W0 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chmp1aQ921W0 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chmp1aQ921W0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chmp1aQ921W0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chmp1aQ921W0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chmp1aQ921W0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chmp1aQ921W0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chmp1aQ921W0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chmp1aQ921W0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chmp1aQ921W0 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Chmp1aQ921W0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Chmp1aQ921W0 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chmp1aQ921W0 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chmp1aQ921W0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chmp1aQ921W0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chmp1aQ921W0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chmp1aQ921W0 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chmp1aQ921W0 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chmp1aQ921W0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chmp1aQ921W0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chmp1aQ921W0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chmp1aQ921W0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chmp1aQ921W0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chmp1aQ921W0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chmp1aQ921W0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chmp1aQ921W0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chmp1aQ921W0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chmp1aQ921W0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chmp1aQ921W0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chmp1aQ921W0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chmp1aQ921W0 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chmp1aQ921W0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chmp1aQ921W0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chmp1aQ921W0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chmp1aQ921W0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chmp1aQ921W0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chmp1aQ921W0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chmp1aQ921W0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chmp1aQ921W0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Chmp1aQ921W0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chmp1aQ921W0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chmp1aQ921W0 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chmp1aQ921W0 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chmp1aQ921W0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chmp1aQ921W0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chmp1aQ921W0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Chmp1aQ921W0 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chmp1aQ921W0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms