Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Med28Q920D3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Med28Q920D3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Med28Q920D3 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Med28Q920D3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Med28Q920D3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Med28Q920D3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Med28Q920D3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Med28Q920D3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Med28Q920D3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Med28Q920D3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Med28Q920D3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Med28Q920D3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Med28Q920D3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Med28Q920D3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Med28Q920D3 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Med28Q920D3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Med28Q920D3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Med28Q920D3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Med28Q920D3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Med28Q920D3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Med28Q920D3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Med28Q920D3 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Med28Q920D3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Med28Q920D3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Med28Q920D3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Med28Q920D3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Med28Q920D3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Med28Q920D3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Med28Q920D3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Med28Q920D3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Med28Q920D3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Med28Q920D3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Med28Q920D3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Med28Q920D3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Med28Q920D3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Med28Q920D3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Med28Q920D3 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Med28Q920D3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Med28Q920D3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Med28Q920D3 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Med28Q920D3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Med28Q920D3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Med28Q920D3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Med28Q920D3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Med28Q920D3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Med28Q920D3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Med28Q920D3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Med28Q920D3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Med28Q920D3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Med28Q920D3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Med28Q920D3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Med28Q920D3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Med28Q920D3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Med28Q920D3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Med28Q920D3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Med28Q920D3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Med28Q920D3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Med28Q920D3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Med28Q920D3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Med28Q920D3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Med28Q920D3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Med28Q920D3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Med28Q920D3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Med28Q920D3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Med28Q920D3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Med28Q920D3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Med28Q920D3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Med28Q920D3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Med28Q920D3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Med28Q920D3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Med28Q920D3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Med28Q920D3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Med28Q920D3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Med28Q920D3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Med28Q920D3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Med28Q920D3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Med28Q920D3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Med28Q920D3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Med28Q920D3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Med28Q920D3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Med28Q920D3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Med28Q920D3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Med28Q920D3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Med28Q920D3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Med28Q920D3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Med28Q920D3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Med28Q920D3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Med28Q920D3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Med28Q920D3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Med28Q920D3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Med28Q920D3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Med28Q920D3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Med28Q920D3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Med28Q920D3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Med28Q920D3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Med28Q920D3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Med28Q920D3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Med28Q920D3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Med28Q920D3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms