Protein–RNA interactions for Protein: Q91YN0

D6Wsu163e, Protein C12orf4 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Wsu163eQ91YN0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
D6Wsu163eQ91YN0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
D6Wsu163eQ91YN0 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
D6Wsu163eQ91YN0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
D6Wsu163eQ91YN0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
D6Wsu163eQ91YN0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
D6Wsu163eQ91YN0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
D6Wsu163eQ91YN0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
D6Wsu163eQ91YN0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
D6Wsu163eQ91YN0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
D6Wsu163eQ91YN0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
D6Wsu163eQ91YN0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
D6Wsu163eQ91YN0 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
D6Wsu163eQ91YN0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
D6Wsu163eQ91YN0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
D6Wsu163eQ91YN0 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
D6Wsu163eQ91YN0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
D6Wsu163eQ91YN0 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
D6Wsu163eQ91YN0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
D6Wsu163eQ91YN0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
D6Wsu163eQ91YN0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
D6Wsu163eQ91YN0 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
D6Wsu163eQ91YN0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
D6Wsu163eQ91YN0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
D6Wsu163eQ91YN0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
D6Wsu163eQ91YN0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
D6Wsu163eQ91YN0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
D6Wsu163eQ91YN0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
D6Wsu163eQ91YN0 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
D6Wsu163eQ91YN0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
D6Wsu163eQ91YN0 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
D6Wsu163eQ91YN0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
D6Wsu163eQ91YN0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
D6Wsu163eQ91YN0 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
D6Wsu163eQ91YN0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
D6Wsu163eQ91YN0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
D6Wsu163eQ91YN0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
D6Wsu163eQ91YN0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
D6Wsu163eQ91YN0 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
D6Wsu163eQ91YN0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
D6Wsu163eQ91YN0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
D6Wsu163eQ91YN0 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
D6Wsu163eQ91YN0 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
D6Wsu163eQ91YN0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
D6Wsu163eQ91YN0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
D6Wsu163eQ91YN0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
D6Wsu163eQ91YN0 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
D6Wsu163eQ91YN0 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
D6Wsu163eQ91YN0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
D6Wsu163eQ91YN0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
D6Wsu163eQ91YN0 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
D6Wsu163eQ91YN0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
D6Wsu163eQ91YN0 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
D6Wsu163eQ91YN0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
D6Wsu163eQ91YN0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
D6Wsu163eQ91YN0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
D6Wsu163eQ91YN0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
D6Wsu163eQ91YN0 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
D6Wsu163eQ91YN0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
D6Wsu163eQ91YN0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
D6Wsu163eQ91YN0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
D6Wsu163eQ91YN0 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
D6Wsu163eQ91YN0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
D6Wsu163eQ91YN0 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
D6Wsu163eQ91YN0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
D6Wsu163eQ91YN0 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
D6Wsu163eQ91YN0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
D6Wsu163eQ91YN0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
D6Wsu163eQ91YN0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
D6Wsu163eQ91YN0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
D6Wsu163eQ91YN0 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
D6Wsu163eQ91YN0 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
D6Wsu163eQ91YN0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
D6Wsu163eQ91YN0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
D6Wsu163eQ91YN0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
D6Wsu163eQ91YN0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
D6Wsu163eQ91YN0 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
D6Wsu163eQ91YN0 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
D6Wsu163eQ91YN0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
D6Wsu163eQ91YN0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
D6Wsu163eQ91YN0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
D6Wsu163eQ91YN0 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
D6Wsu163eQ91YN0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
D6Wsu163eQ91YN0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
D6Wsu163eQ91YN0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
D6Wsu163eQ91YN0 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
D6Wsu163eQ91YN0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
D6Wsu163eQ91YN0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
D6Wsu163eQ91YN0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
D6Wsu163eQ91YN0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
D6Wsu163eQ91YN0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
D6Wsu163eQ91YN0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
D6Wsu163eQ91YN0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
D6Wsu163eQ91YN0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
D6Wsu163eQ91YN0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
D6Wsu163eQ91YN0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
D6Wsu163eQ91YN0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
D6Wsu163eQ91YN0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
D6Wsu163eQ91YN0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
D6Wsu163eQ91YN0 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms