Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK2

Rrp1b, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1bQ91YK2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rrp1bQ91YK2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rrp1bQ91YK2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rrp1bQ91YK2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rrp1bQ91YK2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rrp1bQ91YK2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rrp1bQ91YK2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rrp1bQ91YK2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rrp1bQ91YK2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rrp1bQ91YK2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rrp1bQ91YK2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rrp1bQ91YK2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rrp1bQ91YK2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rrp1bQ91YK2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rrp1bQ91YK2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Rrp1bQ91YK2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rrp1bQ91YK2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rrp1bQ91YK2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rrp1bQ91YK2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rrp1bQ91YK2 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Rrp1bQ91YK2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rrp1bQ91YK2 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rrp1bQ91YK2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rrp1bQ91YK2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rrp1bQ91YK2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Rrp1bQ91YK2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rrp1bQ91YK2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rrp1bQ91YK2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rrp1bQ91YK2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rrp1bQ91YK2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rrp1bQ91YK2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rrp1bQ91YK2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rrp1bQ91YK2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rrp1bQ91YK2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rrp1bQ91YK2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rrp1bQ91YK2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rrp1bQ91YK2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rrp1bQ91YK2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rrp1bQ91YK2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rrp1bQ91YK2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rrp1bQ91YK2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rrp1bQ91YK2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rrp1bQ91YK2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rrp1bQ91YK2 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rrp1bQ91YK2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rrp1bQ91YK2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rrp1bQ91YK2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rrp1bQ91YK2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rrp1bQ91YK2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rrp1bQ91YK2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rrp1bQ91YK2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Rrp1bQ91YK2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Rrp1bQ91YK2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rrp1bQ91YK2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rrp1bQ91YK2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rrp1bQ91YK2 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rrp1bQ91YK2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rrp1bQ91YK2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rrp1bQ91YK2 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rrp1bQ91YK2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rrp1bQ91YK2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rrp1bQ91YK2 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Rrp1bQ91YK2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rrp1bQ91YK2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Rrp1bQ91YK2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rrp1bQ91YK2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rrp1bQ91YK2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rrp1bQ91YK2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rrp1bQ91YK2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rrp1bQ91YK2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rrp1bQ91YK2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rrp1bQ91YK2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rrp1bQ91YK2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rrp1bQ91YK2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rrp1bQ91YK2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Rrp1bQ91YK2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rrp1bQ91YK2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rrp1bQ91YK2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rrp1bQ91YK2 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rrp1bQ91YK2 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rrp1bQ91YK2 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rrp1bQ91YK2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rrp1bQ91YK2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rrp1bQ91YK2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Rrp1bQ91YK2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rrp1bQ91YK2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rrp1bQ91YK2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rrp1bQ91YK2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rrp1bQ91YK2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Rrp1bQ91YK2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rrp1bQ91YK2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rrp1bQ91YK2 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rrp1bQ91YK2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rrp1bQ91YK2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rrp1bQ91YK2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rrp1bQ91YK2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Rrp1bQ91YK2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rrp1bQ91YK2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rrp1bQ91YK2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rrp1bQ91YK2 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82 ms