Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y15

Pcdha5, Protocadherin alpha 5, mousemouse

Predictions only

Length 934 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha5Q91Y15 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Pcdha5Q91Y15 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
Pcdha5Q91Y15 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Pcdha5Q91Y15 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Pcdha5Q91Y15 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pcdha5Q91Y15 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pcdha5Q91Y15 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pcdha5Q91Y15 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pcdha5Q91Y15 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pcdha5Q91Y15 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Pcdha5Q91Y15 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Pcdha5Q91Y15 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Pcdha5Q91Y15 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Pcdha5Q91Y15 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Pcdha5Q91Y15 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Pcdha5Q91Y15 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pcdha5Q91Y15 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pcdha5Q91Y15 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Pcdha5Q91Y15 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pcdha5Q91Y15 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pcdha5Q91Y15 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pcdha5Q91Y15 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pcdha5Q91Y15 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pcdha5Q91Y15 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Pcdha5Q91Y15 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pcdha5Q91Y15 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pcdha5Q91Y15 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pcdha5Q91Y15 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pcdha5Q91Y15 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pcdha5Q91Y15 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pcdha5Q91Y15 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pcdha5Q91Y15 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Pcdha5Q91Y15 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pcdha5Q91Y15 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pcdha5Q91Y15 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pcdha5Q91Y15 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pcdha5Q91Y15 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pcdha5Q91Y15 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pcdha5Q91Y15 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pcdha5Q91Y15 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pcdha5Q91Y15 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pcdha5Q91Y15 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pcdha5Q91Y15 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pcdha5Q91Y15 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pcdha5Q91Y15 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pcdha5Q91Y15 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pcdha5Q91Y15 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pcdha5Q91Y15 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pcdha5Q91Y15 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pcdha5Q91Y15 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pcdha5Q91Y15 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Pcdha5Q91Y15 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pcdha5Q91Y15 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pcdha5Q91Y15 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pcdha5Q91Y15 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pcdha5Q91Y15 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pcdha5Q91Y15 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pcdha5Q91Y15 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pcdha5Q91Y15 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pcdha5Q91Y15 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pcdha5Q91Y15 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Pcdha5Q91Y15 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pcdha5Q91Y15 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pcdha5Q91Y15 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pcdha5Q91Y15 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pcdha5Q91Y15 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pcdha5Q91Y15 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pcdha5Q91Y15 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pcdha5Q91Y15 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pcdha5Q91Y15 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pcdha5Q91Y15 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pcdha5Q91Y15 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Pcdha5Q91Y15 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pcdha5Q91Y15 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pcdha5Q91Y15 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pcdha5Q91Y15 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pcdha5Q91Y15 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pcdha5Q91Y15 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pcdha5Q91Y15 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pcdha5Q91Y15 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pcdha5Q91Y15 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pcdha5Q91Y15 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pcdha5Q91Y15 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Pcdha5Q91Y15 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pcdha5Q91Y15 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pcdha5Q91Y15 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pcdha5Q91Y15 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pcdha5Q91Y15 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pcdha5Q91Y15 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pcdha5Q91Y15 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pcdha5Q91Y15 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pcdha5Q91Y15 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pcdha5Q91Y15 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pcdha5Q91Y15 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pcdha5Q91Y15 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pcdha5Q91Y15 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pcdha5Q91Y15 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pcdha5Q91Y15 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pcdha5Q91Y15 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pcdha5Q91Y15 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.1 ms