Protein–RNA interactions for Protein: Q91XY5

Pcdhga3, Protocadherin gamma A3, mousemouse

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhga3Q91XY5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcdhga3Q91XY5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcdhga3Q91XY5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcdhga3Q91XY5 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcdhga3Q91XY5 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcdhga3Q91XY5 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcdhga3Q91XY5 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pcdhga3Q91XY5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcdhga3Q91XY5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcdhga3Q91XY5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcdhga3Q91XY5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcdhga3Q91XY5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcdhga3Q91XY5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdhga3Q91XY5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcdhga3Q91XY5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pcdhga3Q91XY5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcdhga3Q91XY5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcdhga3Q91XY5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcdhga3Q91XY5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcdhga3Q91XY5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pcdhga3Q91XY5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdhga3Q91XY5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdhga3Q91XY5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdhga3Q91XY5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdhga3Q91XY5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdhga3Q91XY5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdhga3Q91XY5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdhga3Q91XY5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdhga3Q91XY5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdhga3Q91XY5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdhga3Q91XY5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdhga3Q91XY5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdhga3Q91XY5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdhga3Q91XY5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdhga3Q91XY5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcdhga3Q91XY5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcdhga3Q91XY5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcdhga3Q91XY5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcdhga3Q91XY5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcdhga3Q91XY5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcdhga3Q91XY5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcdhga3Q91XY5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcdhga3Q91XY5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcdhga3Q91XY5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcdhga3Q91XY5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcdhga3Q91XY5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcdhga3Q91XY5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcdhga3Q91XY5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcdhga3Q91XY5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcdhga3Q91XY5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcdhga3Q91XY5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcdhga3Q91XY5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcdhga3Q91XY5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcdhga3Q91XY5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcdhga3Q91XY5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcdhga3Q91XY5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcdhga3Q91XY5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcdhga3Q91XY5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcdhga3Q91XY5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcdhga3Q91XY5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcdhga3Q91XY5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcdhga3Q91XY5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcdhga3Q91XY5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcdhga3Q91XY5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcdhga3Q91XY5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcdhga3Q91XY5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcdhga3Q91XY5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcdhga3Q91XY5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcdhga3Q91XY5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcdhga3Q91XY5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcdhga3Q91XY5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdhga3Q91XY5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdhga3Q91XY5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdhga3Q91XY5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdhga3Q91XY5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdhga3Q91XY5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcdhga3Q91XY5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcdhga3Q91XY5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcdhga3Q91XY5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcdhga3Q91XY5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcdhga3Q91XY5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcdhga3Q91XY5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcdhga3Q91XY5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcdhga3Q91XY5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcdhga3Q91XY5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcdhga3Q91XY5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcdhga3Q91XY5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcdhga3Q91XY5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcdhga3Q91XY5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcdhga3Q91XY5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcdhga3Q91XY5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pcdhga3Q91XY5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcdhga3Q91XY5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcdhga3Q91XY5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcdhga3Q91XY5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcdhga3Q91XY5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcdhga3Q91XY5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcdhga3Q91XY5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcdhga3Q91XY5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcdhga3Q91XY5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms