Protein–RNA interactions for Protein: Q91WL6

Snx11, Sorting nexin-11, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx11Q91WL6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Snx11Q91WL6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Snx11Q91WL6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Snx11Q91WL6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Snx11Q91WL6 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Snx11Q91WL6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Snx11Q91WL6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Snx11Q91WL6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Snx11Q91WL6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Snx11Q91WL6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Snx11Q91WL6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Snx11Q91WL6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Snx11Q91WL6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Snx11Q91WL6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Snx11Q91WL6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Snx11Q91WL6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Snx11Q91WL6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Snx11Q91WL6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Snx11Q91WL6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Snx11Q91WL6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Snx11Q91WL6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Snx11Q91WL6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Snx11Q91WL6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Snx11Q91WL6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Snx11Q91WL6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Snx11Q91WL6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Snx11Q91WL6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Snx11Q91WL6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Snx11Q91WL6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Snx11Q91WL6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Snx11Q91WL6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Snx11Q91WL6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Snx11Q91WL6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Snx11Q91WL6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Snx11Q91WL6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Snx11Q91WL6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Snx11Q91WL6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Snx11Q91WL6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Snx11Q91WL6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Snx11Q91WL6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Snx11Q91WL6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Snx11Q91WL6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Snx11Q91WL6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Snx11Q91WL6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Snx11Q91WL6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Snx11Q91WL6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Snx11Q91WL6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Snx11Q91WL6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Snx11Q91WL6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Snx11Q91WL6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Snx11Q91WL6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Snx11Q91WL6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Snx11Q91WL6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Snx11Q91WL6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Snx11Q91WL6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Snx11Q91WL6 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Snx11Q91WL6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Snx11Q91WL6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Snx11Q91WL6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Snx11Q91WL6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Snx11Q91WL6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Snx11Q91WL6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Snx11Q91WL6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Snx11Q91WL6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Snx11Q91WL6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Snx11Q91WL6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Snx11Q91WL6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Snx11Q91WL6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Snx11Q91WL6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Snx11Q91WL6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Snx11Q91WL6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Snx11Q91WL6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Snx11Q91WL6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Snx11Q91WL6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Snx11Q91WL6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Snx11Q91WL6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Snx11Q91WL6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Snx11Q91WL6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Snx11Q91WL6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Snx11Q91WL6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Snx11Q91WL6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Snx11Q91WL6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Snx11Q91WL6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Snx11Q91WL6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Snx11Q91WL6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Snx11Q91WL6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Snx11Q91WL6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Snx11Q91WL6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Snx11Q91WL6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Snx11Q91WL6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Snx11Q91WL6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Snx11Q91WL6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Snx11Q91WL6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Snx11Q91WL6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Snx11Q91WL6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Snx11Q91WL6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Snx11Q91WL6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Snx11Q91WL6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Snx11Q91WL6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Snx11Q91WL6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms