Protein–RNA interactions for Protein: Q91W29

Cox4i2, Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox4i2Q91W29 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cox4i2Q91W29 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cox4i2Q91W29 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cox4i2Q91W29 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cox4i2Q91W29 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cox4i2Q91W29 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cox4i2Q91W29 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Cox4i2Q91W29 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cox4i2Q91W29 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cox4i2Q91W29 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cox4i2Q91W29 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cox4i2Q91W29 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cox4i2Q91W29 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cox4i2Q91W29 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cox4i2Q91W29 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cox4i2Q91W29 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Cox4i2Q91W29 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cox4i2Q91W29 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cox4i2Q91W29 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cox4i2Q91W29 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cox4i2Q91W29 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cox4i2Q91W29 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cox4i2Q91W29 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Cox4i2Q91W29 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cox4i2Q91W29 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cox4i2Q91W29 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cox4i2Q91W29 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cox4i2Q91W29 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cox4i2Q91W29 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cox4i2Q91W29 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cox4i2Q91W29 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Cox4i2Q91W29 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cox4i2Q91W29 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cox4i2Q91W29 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cox4i2Q91W29 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cox4i2Q91W29 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cox4i2Q91W29 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cox4i2Q91W29 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cox4i2Q91W29 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cox4i2Q91W29 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Cox4i2Q91W29 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cox4i2Q91W29 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cox4i2Q91W29 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cox4i2Q91W29 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cox4i2Q91W29 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cox4i2Q91W29 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cox4i2Q91W29 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cox4i2Q91W29 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cox4i2Q91W29 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cox4i2Q91W29 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cox4i2Q91W29 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cox4i2Q91W29 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cox4i2Q91W29 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cox4i2Q91W29 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cox4i2Q91W29 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cox4i2Q91W29 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cox4i2Q91W29 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cox4i2Q91W29 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cox4i2Q91W29 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cox4i2Q91W29 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cox4i2Q91W29 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cox4i2Q91W29 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cox4i2Q91W29 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cox4i2Q91W29 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cox4i2Q91W29 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Cox4i2Q91W29 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cox4i2Q91W29 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cox4i2Q91W29 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cox4i2Q91W29 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cox4i2Q91W29 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cox4i2Q91W29 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cox4i2Q91W29 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cox4i2Q91W29 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cox4i2Q91W29 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cox4i2Q91W29 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cox4i2Q91W29 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cox4i2Q91W29 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cox4i2Q91W29 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cox4i2Q91W29 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cox4i2Q91W29 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cox4i2Q91W29 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cox4i2Q91W29 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cox4i2Q91W29 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cox4i2Q91W29 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cox4i2Q91W29 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cox4i2Q91W29 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cox4i2Q91W29 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cox4i2Q91W29 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cox4i2Q91W29 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cox4i2Q91W29 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cox4i2Q91W29 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cox4i2Q91W29 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cox4i2Q91W29 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cox4i2Q91W29 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cox4i2Q91W29 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cox4i2Q91W29 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cox4i2Q91W29 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cox4i2Q91W29 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cox4i2Q91W29 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cox4i2Q91W29 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms