Protein–RNA interactions for Protein: Q91VS8

Farp2, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,065 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp2Q91VS8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
Farp2Q91VS8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Farp2Q91VS8 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Farp2Q91VS8 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
Farp2Q91VS8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Farp2Q91VS8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Farp2Q91VS8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Farp2Q91VS8 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Farp2Q91VS8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Farp2Q91VS8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Farp2Q91VS8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Farp2Q91VS8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Farp2Q91VS8 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Farp2Q91VS8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
Farp2Q91VS8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
Farp2Q91VS8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Farp2Q91VS8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Farp2Q91VS8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
Farp2Q91VS8 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC36.43■■■■□ 3.42
Farp2Q91VS8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Farp2Q91VS8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Farp2Q91VS8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Farp2Q91VS8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
Farp2Q91VS8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Farp2Q91VS8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Farp2Q91VS8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
Farp2Q91VS8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
Farp2Q91VS8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Farp2Q91VS8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Farp2Q91VS8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Farp2Q91VS8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Farp2Q91VS8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Farp2Q91VS8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
Farp2Q91VS8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Farp2Q91VS8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
Farp2Q91VS8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
Farp2Q91VS8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Farp2Q91VS8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
Farp2Q91VS8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Farp2Q91VS8 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Farp2Q91VS8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Farp2Q91VS8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
Farp2Q91VS8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Farp2Q91VS8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
Farp2Q91VS8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Farp2Q91VS8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Farp2Q91VS8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
Farp2Q91VS8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Farp2Q91VS8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Farp2Q91VS8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Farp2Q91VS8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC36.1■■■■□ 3.37
Farp2Q91VS8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Farp2Q91VS8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC36.1■■■■□ 3.37
Farp2Q91VS8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC36.09■■■■□ 3.37
Farp2Q91VS8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Farp2Q91VS8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Farp2Q91VS8 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
Farp2Q91VS8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Farp2Q91VS8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
Farp2Q91VS8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Farp2Q91VS8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Farp2Q91VS8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Farp2Q91VS8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
Farp2Q91VS8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
Farp2Q91VS8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
Farp2Q91VS8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Farp2Q91VS8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Farp2Q91VS8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
Farp2Q91VS8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Farp2Q91VS8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
Farp2Q91VS8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Farp2Q91VS8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
Farp2Q91VS8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
Farp2Q91VS8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Farp2Q91VS8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Farp2Q91VS8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
Farp2Q91VS8 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Farp2Q91VS8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
Farp2Q91VS8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC35.61■■■■□ 3.29
Farp2Q91VS8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
Farp2Q91VS8 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
Farp2Q91VS8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Farp2Q91VS8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
Farp2Q91VS8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Farp2Q91VS8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Farp2Q91VS8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Farp2Q91VS8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Farp2Q91VS8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Farp2Q91VS8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Farp2Q91VS8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Farp2Q91VS8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC35.47■■■■□ 3.27
Farp2Q91VS8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
Farp2Q91VS8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Farp2Q91VS8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Farp2Q91VS8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Farp2Q91VS8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
Farp2Q91VS8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Farp2Q91VS8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Farp2Q91VS8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Farp2Q91VS8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms