Protein–RNA interactions for Protein: Q91VJ2

Cavin3, Caveolae-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cavin3Q91VJ2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cavin3Q91VJ2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cavin3Q91VJ2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cavin3Q91VJ2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cavin3Q91VJ2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cavin3Q91VJ2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cavin3Q91VJ2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Cavin3Q91VJ2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cavin3Q91VJ2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cavin3Q91VJ2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cavin3Q91VJ2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cavin3Q91VJ2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cavin3Q91VJ2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Cavin3Q91VJ2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cavin3Q91VJ2 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Cavin3Q91VJ2 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cavin3Q91VJ2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cavin3Q91VJ2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cavin3Q91VJ2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cavin3Q91VJ2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cavin3Q91VJ2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cavin3Q91VJ2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cavin3Q91VJ2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cavin3Q91VJ2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cavin3Q91VJ2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cavin3Q91VJ2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cavin3Q91VJ2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cavin3Q91VJ2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cavin3Q91VJ2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cavin3Q91VJ2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cavin3Q91VJ2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cavin3Q91VJ2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Cavin3Q91VJ2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cavin3Q91VJ2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cavin3Q91VJ2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cavin3Q91VJ2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cavin3Q91VJ2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cavin3Q91VJ2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cavin3Q91VJ2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cavin3Q91VJ2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cavin3Q91VJ2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cavin3Q91VJ2 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cavin3Q91VJ2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cavin3Q91VJ2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Cavin3Q91VJ2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cavin3Q91VJ2 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cavin3Q91VJ2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cavin3Q91VJ2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cavin3Q91VJ2 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cavin3Q91VJ2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cavin3Q91VJ2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cavin3Q91VJ2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cavin3Q91VJ2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cavin3Q91VJ2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cavin3Q91VJ2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cavin3Q91VJ2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Cavin3Q91VJ2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cavin3Q91VJ2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cavin3Q91VJ2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cavin3Q91VJ2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cavin3Q91VJ2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cavin3Q91VJ2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cavin3Q91VJ2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cavin3Q91VJ2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cavin3Q91VJ2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cavin3Q91VJ2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cavin3Q91VJ2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cavin3Q91VJ2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cavin3Q91VJ2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cavin3Q91VJ2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cavin3Q91VJ2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cavin3Q91VJ2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cavin3Q91VJ2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cavin3Q91VJ2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cavin3Q91VJ2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cavin3Q91VJ2 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cavin3Q91VJ2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cavin3Q91VJ2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cavin3Q91VJ2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cavin3Q91VJ2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cavin3Q91VJ2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Cavin3Q91VJ2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cavin3Q91VJ2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cavin3Q91VJ2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cavin3Q91VJ2 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cavin3Q91VJ2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cavin3Q91VJ2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cavin3Q91VJ2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cavin3Q91VJ2 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cavin3Q91VJ2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cavin3Q91VJ2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cavin3Q91VJ2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cavin3Q91VJ2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cavin3Q91VJ2 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cavin3Q91VJ2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cavin3Q91VJ2 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cavin3Q91VJ2 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cavin3Q91VJ2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cavin3Q91VJ2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cavin3Q91VJ2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms