Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE99

Ccdc115, Coiled-coil domain-containing protein 115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc115Q8VE99 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc115Q8VE99 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc115Q8VE99 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc115Q8VE99 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc115Q8VE99 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc115Q8VE99 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc115Q8VE99 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc115Q8VE99 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc115Q8VE99 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc115Q8VE99 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc115Q8VE99 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc115Q8VE99 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc115Q8VE99 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc115Q8VE99 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc115Q8VE99 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc115Q8VE99 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc115Q8VE99 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc115Q8VE99 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc115Q8VE99 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc115Q8VE99 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc115Q8VE99 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc115Q8VE99 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc115Q8VE99 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc115Q8VE99 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc115Q8VE99 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc115Q8VE99 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc115Q8VE99 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc115Q8VE99 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc115Q8VE99 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc115Q8VE99 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc115Q8VE99 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc115Q8VE99 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc115Q8VE99 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc115Q8VE99 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc115Q8VE99 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc115Q8VE99 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc115Q8VE99 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc115Q8VE99 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc115Q8VE99 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc115Q8VE99 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc115Q8VE99 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc115Q8VE99 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc115Q8VE99 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc115Q8VE99 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc115Q8VE99 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc115Q8VE99 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc115Q8VE99 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc115Q8VE99 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc115Q8VE99 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc115Q8VE99 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc115Q8VE99 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc115Q8VE99 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc115Q8VE99 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc115Q8VE99 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc115Q8VE99 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc115Q8VE99 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc115Q8VE99 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc115Q8VE99 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc115Q8VE99 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc115Q8VE99 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc115Q8VE99 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc115Q8VE99 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc115Q8VE99 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc115Q8VE99 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc115Q8VE99 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc115Q8VE99 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc115Q8VE99 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc115Q8VE99 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc115Q8VE99 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc115Q8VE99 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc115Q8VE99 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc115Q8VE99 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc115Q8VE99 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc115Q8VE99 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc115Q8VE99 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc115Q8VE99 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc115Q8VE99 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc115Q8VE99 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc115Q8VE99 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc115Q8VE99 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc115Q8VE99 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc115Q8VE99 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc115Q8VE99 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc115Q8VE99 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc115Q8VE99 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc115Q8VE99 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc115Q8VE99 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc115Q8VE99 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc115Q8VE99 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc115Q8VE99 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc115Q8VE99 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc115Q8VE99 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc115Q8VE99 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc115Q8VE99 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc115Q8VE99 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc115Q8VE99 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc115Q8VE99 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc115Q8VE99 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc115Q8VE99 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ccdc115Q8VE99 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms