Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE73

Cul7, Cullin-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul7Q8VE73 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
Cul7Q8VE73 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
Cul7Q8VE73 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
Cul7Q8VE73 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC41.6■■■■■ 4.25
Cul7Q8VE73 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
Cul7Q8VE73 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
Cul7Q8VE73 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
Cul7Q8VE73 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC41.53■■■■■ 4.24
Cul7Q8VE73 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
Cul7Q8VE73 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
Cul7Q8VE73 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
Cul7Q8VE73 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
Cul7Q8VE73 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
Cul7Q8VE73 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC41.44■■■■■ 4.22
Cul7Q8VE73 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
Cul7Q8VE73 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
Cul7Q8VE73 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.38■■■■■ 4.22
Cul7Q8VE73 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
Cul7Q8VE73 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
Cul7Q8VE73 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC41.3■■■■■ 4.2
Cul7Q8VE73 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
Cul7Q8VE73 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC41.3■■■■■ 4.2
Cul7Q8VE73 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC41.26■■■■■ 4.2
Cul7Q8VE73 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
Cul7Q8VE73 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.25■■■■■ 4.19
Cul7Q8VE73 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
Cul7Q8VE73 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
Cul7Q8VE73 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
Cul7Q8VE73 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
Cul7Q8VE73 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
Cul7Q8VE73 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
Cul7Q8VE73 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
Cul7Q8VE73 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC41.17■■■■■ 4.18
Cul7Q8VE73 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC41.17■■■■■ 4.18
Cul7Q8VE73 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC41.16■■■■■ 4.18
Cul7Q8VE73 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
Cul7Q8VE73 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
Cul7Q8VE73 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.09■■■■■ 4.17
Cul7Q8VE73 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
Cul7Q8VE73 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.07■■■■■ 4.17
Cul7Q8VE73 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC41.07■■■■■ 4.17
Cul7Q8VE73 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
Cul7Q8VE73 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
Cul7Q8VE73 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
Cul7Q8VE73 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.04■■■■■ 4.16
Cul7Q8VE73 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
Cul7Q8VE73 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
Cul7Q8VE73 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
Cul7Q8VE73 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
Cul7Q8VE73 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
Cul7Q8VE73 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC40.98■■■■■ 4.15
Cul7Q8VE73 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC40.97■■■■■ 4.15
Cul7Q8VE73 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC40.97■■■■■ 4.15
Cul7Q8VE73 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
Cul7Q8VE73 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC40.94■■■■■ 4.14
Cul7Q8VE73 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC40.91■■■■■ 4.14
Cul7Q8VE73 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC40.89■■■■■ 4.14
Cul7Q8VE73 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC40.87■■■■■ 4.13
Cul7Q8VE73 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
Cul7Q8VE73 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC40.84■■■■■ 4.13
Cul7Q8VE73 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC40.83■■■■■ 4.13
Cul7Q8VE73 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC40.8■■■■■ 4.12
Cul7Q8VE73 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC40.79■■■■■ 4.12
Cul7Q8VE73 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
Cul7Q8VE73 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
Cul7Q8VE73 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC40.72■■■■■ 4.11
Cul7Q8VE73 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
Cul7Q8VE73 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
Cul7Q8VE73 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
Cul7Q8VE73 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC40.7■■■■■ 4.11
Cul7Q8VE73 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC40.7■■■■■ 4.11
Cul7Q8VE73 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
Cul7Q8VE73 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
Cul7Q8VE73 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC40.53■■■■■ 4.08
Cul7Q8VE73 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
Cul7Q8VE73 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC40.5■■■■■ 4.07
Cul7Q8VE73 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.44■■■■■ 4.06
Cul7Q8VE73 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
Cul7Q8VE73 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC40.42■■■■■ 4.06
Cul7Q8VE73 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC40.41■■■■■ 4.06
Cul7Q8VE73 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC40.37■■■■■ 4.05
Cul7Q8VE73 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
Cul7Q8VE73 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
Cul7Q8VE73 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
Cul7Q8VE73 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC40.27■■■■■ 4.04
Cul7Q8VE73 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
Cul7Q8VE73 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
Cul7Q8VE73 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
Cul7Q8VE73 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC40.24■■■■■ 4.03
Cul7Q8VE73 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
Cul7Q8VE73 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
Cul7Q8VE73 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
Cul7Q8VE73 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.18■■■■■ 4.02
Cul7Q8VE73 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC40.18■■■■■ 4.02
Cul7Q8VE73 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
Cul7Q8VE73 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
Cul7Q8VE73 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.16■■■■■ 4.02
Cul7Q8VE73 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC40.15■■■■■ 4.02
Cul7Q8VE73 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.15■■■■■ 4.02
Cul7Q8VE73 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms