Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS8

Stx18, Syntaxin-18, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx18Q8VDS8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Stx18Q8VDS8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Stx18Q8VDS8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Stx18Q8VDS8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Stx18Q8VDS8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Stx18Q8VDS8 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Stx18Q8VDS8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Stx18Q8VDS8 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Stx18Q8VDS8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Stx18Q8VDS8 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Stx18Q8VDS8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Stx18Q8VDS8 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Stx18Q8VDS8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Stx18Q8VDS8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Stx18Q8VDS8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Stx18Q8VDS8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Stx18Q8VDS8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Stx18Q8VDS8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Stx18Q8VDS8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Stx18Q8VDS8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Stx18Q8VDS8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Stx18Q8VDS8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Stx18Q8VDS8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Stx18Q8VDS8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Stx18Q8VDS8 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Stx18Q8VDS8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Stx18Q8VDS8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Stx18Q8VDS8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Stx18Q8VDS8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Stx18Q8VDS8 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Stx18Q8VDS8 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Stx18Q8VDS8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Stx18Q8VDS8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Stx18Q8VDS8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Stx18Q8VDS8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Stx18Q8VDS8 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Stx18Q8VDS8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Stx18Q8VDS8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Stx18Q8VDS8 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Stx18Q8VDS8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Stx18Q8VDS8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Stx18Q8VDS8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Stx18Q8VDS8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Stx18Q8VDS8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Stx18Q8VDS8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Stx18Q8VDS8 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Stx18Q8VDS8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Stx18Q8VDS8 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Stx18Q8VDS8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Stx18Q8VDS8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Stx18Q8VDS8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Stx18Q8VDS8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Stx18Q8VDS8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Stx18Q8VDS8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Stx18Q8VDS8 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Stx18Q8VDS8 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Stx18Q8VDS8 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Stx18Q8VDS8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Stx18Q8VDS8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Stx18Q8VDS8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Stx18Q8VDS8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Stx18Q8VDS8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Stx18Q8VDS8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Stx18Q8VDS8 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Stx18Q8VDS8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Stx18Q8VDS8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Stx18Q8VDS8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Stx18Q8VDS8 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Stx18Q8VDS8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Stx18Q8VDS8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Stx18Q8VDS8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Stx18Q8VDS8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Stx18Q8VDS8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Stx18Q8VDS8 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Stx18Q8VDS8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Stx18Q8VDS8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Stx18Q8VDS8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Stx18Q8VDS8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Stx18Q8VDS8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Stx18Q8VDS8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Stx18Q8VDS8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Stx18Q8VDS8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Stx18Q8VDS8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Stx18Q8VDS8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Stx18Q8VDS8 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Stx18Q8VDS8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Stx18Q8VDS8 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Stx18Q8VDS8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Stx18Q8VDS8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Stx18Q8VDS8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Stx18Q8VDS8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Stx18Q8VDS8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Stx18Q8VDS8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Stx18Q8VDS8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Stx18Q8VDS8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Stx18Q8VDS8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Stx18Q8VDS8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Stx18Q8VDS8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Stx18Q8VDS8 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Stx18Q8VDS8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.9 ms