Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCC6

Ccm2l, Cerebral cavernous malformations 2 protein-like, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccm2lQ8VCC6 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccm2lQ8VCC6 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccm2lQ8VCC6 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccm2lQ8VCC6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccm2lQ8VCC6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccm2lQ8VCC6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccm2lQ8VCC6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccm2lQ8VCC6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccm2lQ8VCC6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccm2lQ8VCC6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccm2lQ8VCC6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccm2lQ8VCC6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccm2lQ8VCC6 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccm2lQ8VCC6 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccm2lQ8VCC6 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccm2lQ8VCC6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccm2lQ8VCC6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccm2lQ8VCC6 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccm2lQ8VCC6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccm2lQ8VCC6 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccm2lQ8VCC6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccm2lQ8VCC6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccm2lQ8VCC6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccm2lQ8VCC6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccm2lQ8VCC6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccm2lQ8VCC6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccm2lQ8VCC6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccm2lQ8VCC6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccm2lQ8VCC6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccm2lQ8VCC6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccm2lQ8VCC6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccm2lQ8VCC6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccm2lQ8VCC6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccm2lQ8VCC6 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccm2lQ8VCC6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccm2lQ8VCC6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccm2lQ8VCC6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccm2lQ8VCC6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccm2lQ8VCC6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccm2lQ8VCC6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccm2lQ8VCC6 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccm2lQ8VCC6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccm2lQ8VCC6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccm2lQ8VCC6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccm2lQ8VCC6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccm2lQ8VCC6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccm2lQ8VCC6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccm2lQ8VCC6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccm2lQ8VCC6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccm2lQ8VCC6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccm2lQ8VCC6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccm2lQ8VCC6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccm2lQ8VCC6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccm2lQ8VCC6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccm2lQ8VCC6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccm2lQ8VCC6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccm2lQ8VCC6 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccm2lQ8VCC6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccm2lQ8VCC6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccm2lQ8VCC6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccm2lQ8VCC6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccm2lQ8VCC6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccm2lQ8VCC6 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccm2lQ8VCC6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccm2lQ8VCC6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccm2lQ8VCC6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccm2lQ8VCC6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccm2lQ8VCC6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccm2lQ8VCC6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccm2lQ8VCC6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccm2lQ8VCC6 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccm2lQ8VCC6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccm2lQ8VCC6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccm2lQ8VCC6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccm2lQ8VCC6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccm2lQ8VCC6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccm2lQ8VCC6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccm2lQ8VCC6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccm2lQ8VCC6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccm2lQ8VCC6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccm2lQ8VCC6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccm2lQ8VCC6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccm2lQ8VCC6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccm2lQ8VCC6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccm2lQ8VCC6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccm2lQ8VCC6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccm2lQ8VCC6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccm2lQ8VCC6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccm2lQ8VCC6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccm2lQ8VCC6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccm2lQ8VCC6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccm2lQ8VCC6 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccm2lQ8VCC6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccm2lQ8VCC6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccm2lQ8VCC6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccm2lQ8VCC6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccm2lQ8VCC6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccm2lQ8VCC6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccm2lQ8VCC6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccm2lQ8VCC6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms