Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4Y8

Rttn, Rotatin, mousemouse

Predictions only

Length 2,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RttnQ8R4Y8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RttnQ8R4Y8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RttnQ8R4Y8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RttnQ8R4Y8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RttnQ8R4Y8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RttnQ8R4Y8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RttnQ8R4Y8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RttnQ8R4Y8 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RttnQ8R4Y8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RttnQ8R4Y8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RttnQ8R4Y8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RttnQ8R4Y8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RttnQ8R4Y8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RttnQ8R4Y8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RttnQ8R4Y8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RttnQ8R4Y8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RttnQ8R4Y8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RttnQ8R4Y8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RttnQ8R4Y8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RttnQ8R4Y8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RttnQ8R4Y8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RttnQ8R4Y8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RttnQ8R4Y8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RttnQ8R4Y8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RttnQ8R4Y8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RttnQ8R4Y8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RttnQ8R4Y8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RttnQ8R4Y8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RttnQ8R4Y8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RttnQ8R4Y8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RttnQ8R4Y8 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RttnQ8R4Y8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RttnQ8R4Y8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RttnQ8R4Y8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RttnQ8R4Y8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RttnQ8R4Y8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RttnQ8R4Y8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RttnQ8R4Y8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RttnQ8R4Y8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RttnQ8R4Y8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RttnQ8R4Y8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RttnQ8R4Y8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RttnQ8R4Y8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RttnQ8R4Y8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RttnQ8R4Y8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RttnQ8R4Y8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RttnQ8R4Y8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RttnQ8R4Y8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RttnQ8R4Y8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RttnQ8R4Y8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RttnQ8R4Y8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RttnQ8R4Y8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RttnQ8R4Y8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RttnQ8R4Y8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RttnQ8R4Y8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RttnQ8R4Y8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RttnQ8R4Y8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RttnQ8R4Y8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RttnQ8R4Y8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RttnQ8R4Y8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RttnQ8R4Y8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RttnQ8R4Y8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RttnQ8R4Y8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RttnQ8R4Y8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RttnQ8R4Y8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RttnQ8R4Y8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RttnQ8R4Y8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RttnQ8R4Y8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RttnQ8R4Y8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RttnQ8R4Y8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RttnQ8R4Y8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RttnQ8R4Y8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RttnQ8R4Y8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RttnQ8R4Y8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RttnQ8R4Y8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RttnQ8R4Y8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RttnQ8R4Y8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RttnQ8R4Y8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RttnQ8R4Y8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RttnQ8R4Y8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RttnQ8R4Y8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RttnQ8R4Y8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RttnQ8R4Y8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RttnQ8R4Y8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RttnQ8R4Y8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RttnQ8R4Y8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RttnQ8R4Y8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RttnQ8R4Y8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RttnQ8R4Y8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RttnQ8R4Y8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RttnQ8R4Y8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RttnQ8R4Y8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RttnQ8R4Y8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RttnQ8R4Y8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RttnQ8R4Y8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RttnQ8R4Y8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RttnQ8R4Y8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RttnQ8R4Y8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RttnQ8R4Y8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RttnQ8R4Y8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.5 ms