Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3P9

Slf1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slf1Q8R3P9 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Slf1Q8R3P9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Slf1Q8R3P9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Slf1Q8R3P9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Slf1Q8R3P9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Slf1Q8R3P9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Slf1Q8R3P9 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Slf1Q8R3P9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Slf1Q8R3P9 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Slf1Q8R3P9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Slf1Q8R3P9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Slf1Q8R3P9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Slf1Q8R3P9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Slf1Q8R3P9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Slf1Q8R3P9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Slf1Q8R3P9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Slf1Q8R3P9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Slf1Q8R3P9 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Slf1Q8R3P9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Slf1Q8R3P9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Slf1Q8R3P9 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Slf1Q8R3P9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Slf1Q8R3P9 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Slf1Q8R3P9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Slf1Q8R3P9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Slf1Q8R3P9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Slf1Q8R3P9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Slf1Q8R3P9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Slf1Q8R3P9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Slf1Q8R3P9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Slf1Q8R3P9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Slf1Q8R3P9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Slf1Q8R3P9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Slf1Q8R3P9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Slf1Q8R3P9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Slf1Q8R3P9 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Slf1Q8R3P9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Slf1Q8R3P9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Slf1Q8R3P9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Slf1Q8R3P9 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Slf1Q8R3P9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Slf1Q8R3P9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Slf1Q8R3P9 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Slf1Q8R3P9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Slf1Q8R3P9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Slf1Q8R3P9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Slf1Q8R3P9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Slf1Q8R3P9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Slf1Q8R3P9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Slf1Q8R3P9 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Slf1Q8R3P9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Slf1Q8R3P9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Slf1Q8R3P9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Slf1Q8R3P9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Slf1Q8R3P9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Slf1Q8R3P9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Slf1Q8R3P9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Slf1Q8R3P9 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Slf1Q8R3P9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Slf1Q8R3P9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Slf1Q8R3P9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Slf1Q8R3P9 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Slf1Q8R3P9 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Slf1Q8R3P9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Slf1Q8R3P9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Slf1Q8R3P9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Slf1Q8R3P9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Slf1Q8R3P9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Slf1Q8R3P9 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Slf1Q8R3P9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Slf1Q8R3P9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Slf1Q8R3P9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Slf1Q8R3P9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Slf1Q8R3P9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Slf1Q8R3P9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Slf1Q8R3P9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Slf1Q8R3P9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Slf1Q8R3P9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Slf1Q8R3P9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Slf1Q8R3P9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Slf1Q8R3P9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Slf1Q8R3P9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Slf1Q8R3P9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Slf1Q8R3P9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Slf1Q8R3P9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Slf1Q8R3P9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Slf1Q8R3P9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Slf1Q8R3P9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Slf1Q8R3P9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Slf1Q8R3P9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Slf1Q8R3P9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Slf1Q8R3P9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Slf1Q8R3P9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Slf1Q8R3P9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Slf1Q8R3P9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Slf1Q8R3P9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Slf1Q8R3P9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Slf1Q8R3P9 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slf1Q8R3P9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slf1Q8R3P9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.7 ms