Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc12Q8R344 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc12Q8R344 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc12Q8R344 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc12Q8R344 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc12Q8R344 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc12Q8R344 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc12Q8R344 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc12Q8R344 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc12Q8R344 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc12Q8R344 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc12Q8R344 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc12Q8R344 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc12Q8R344 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc12Q8R344 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc12Q8R344 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc12Q8R344 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc12Q8R344 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc12Q8R344 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc12Q8R344 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc12Q8R344 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc12Q8R344 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc12Q8R344 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc12Q8R344 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Ccdc12Q8R344 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc12Q8R344 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc12Q8R344 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc12Q8R344 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc12Q8R344 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc12Q8R344 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc12Q8R344 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc12Q8R344 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc12Q8R344 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc12Q8R344 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccdc12Q8R344 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc12Q8R344 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc12Q8R344 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc12Q8R344 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc12Q8R344 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc12Q8R344 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc12Q8R344 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc12Q8R344 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc12Q8R344 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc12Q8R344 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc12Q8R344 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc12Q8R344 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc12Q8R344 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc12Q8R344 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc12Q8R344 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc12Q8R344 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc12Q8R344 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc12Q8R344 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc12Q8R344 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc12Q8R344 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc12Q8R344 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc12Q8R344 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc12Q8R344 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc12Q8R344 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc12Q8R344 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc12Q8R344 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc12Q8R344 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc12Q8R344 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc12Q8R344 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc12Q8R344 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc12Q8R344 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc12Q8R344 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc12Q8R344 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc12Q8R344 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc12Q8R344 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc12Q8R344 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc12Q8R344 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc12Q8R344 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc12Q8R344 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc12Q8R344 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc12Q8R344 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc12Q8R344 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc12Q8R344 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc12Q8R344 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc12Q8R344 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccdc12Q8R344 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc12Q8R344 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc12Q8R344 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc12Q8R344 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc12Q8R344 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc12Q8R344 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc12Q8R344 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc12Q8R344 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc12Q8R344 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc12Q8R344 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc12Q8R344 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc12Q8R344 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc12Q8R344 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc12Q8R344 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc12Q8R344 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc12Q8R344 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc12Q8R344 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc12Q8R344 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc12Q8R344 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc12Q8R344 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc12Q8R344 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms