Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2K8

Uncharacterized protein C1orf54 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8R2K8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q8R2K8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q8R2K8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q8R2K8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q8R2K8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q8R2K8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q8R2K8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q8R2K8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q8R2K8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q8R2K8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q8R2K8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q8R2K8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q8R2K8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q8R2K8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q8R2K8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q8R2K8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q8R2K8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q8R2K8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q8R2K8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q8R2K8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Q8R2K8 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q8R2K8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q8R2K8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q8R2K8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q8R2K8 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q8R2K8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q8R2K8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q8R2K8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q8R2K8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q8R2K8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Q8R2K8 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q8R2K8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q8R2K8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q8R2K8 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q8R2K8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q8R2K8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q8R2K8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Q8R2K8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q8R2K8 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q8R2K8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q8R2K8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q8R2K8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q8R2K8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q8R2K8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q8R2K8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q8R2K8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q8R2K8 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q8R2K8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q8R2K8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q8R2K8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q8R2K8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Q8R2K8 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q8R2K8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Q8R2K8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Q8R2K8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q8R2K8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q8R2K8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q8R2K8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q8R2K8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q8R2K8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q8R2K8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q8R2K8 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q8R2K8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q8R2K8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q8R2K8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q8R2K8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q8R2K8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q8R2K8 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q8R2K8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q8R2K8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q8R2K8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q8R2K8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q8R2K8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q8R2K8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q8R2K8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q8R2K8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q8R2K8 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q8R2K8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q8R2K8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Q8R2K8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Q8R2K8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q8R2K8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q8R2K8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q8R2K8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q8R2K8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q8R2K8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q8R2K8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q8R2K8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q8R2K8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q8R2K8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q8R2K8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q8R2K8 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q8R2K8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q8R2K8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q8R2K8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q8R2K8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q8R2K8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q8R2K8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q8R2K8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q8R2K8 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms