Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxc12Q8K5B8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxc12Q8K5B8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxc12Q8K5B8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxc12Q8K5B8 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxc12Q8K5B8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxc12Q8K5B8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxc12Q8K5B8 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxc12Q8K5B8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxc12Q8K5B8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxc12Q8K5B8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxc12Q8K5B8 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxc12Q8K5B8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxc12Q8K5B8 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxc12Q8K5B8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxc12Q8K5B8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxc12Q8K5B8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxc12Q8K5B8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxc12Q8K5B8 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxc12Q8K5B8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxc12Q8K5B8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxc12Q8K5B8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxc12Q8K5B8 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxc12Q8K5B8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxc12Q8K5B8 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hoxc12Q8K5B8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hoxc12Q8K5B8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxc12Q8K5B8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxc12Q8K5B8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxc12Q8K5B8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxc12Q8K5B8 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxc12Q8K5B8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxc12Q8K5B8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxc12Q8K5B8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxc12Q8K5B8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxc12Q8K5B8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxc12Q8K5B8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxc12Q8K5B8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxc12Q8K5B8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxc12Q8K5B8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxc12Q8K5B8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxc12Q8K5B8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxc12Q8K5B8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxc12Q8K5B8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxc12Q8K5B8 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxc12Q8K5B8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxc12Q8K5B8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxc12Q8K5B8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxc12Q8K5B8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxc12Q8K5B8 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxc12Q8K5B8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxc12Q8K5B8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxc12Q8K5B8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxc12Q8K5B8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxc12Q8K5B8 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxc12Q8K5B8 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxc12Q8K5B8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxc12Q8K5B8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxc12Q8K5B8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxc12Q8K5B8 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxc12Q8K5B8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxc12Q8K5B8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxc12Q8K5B8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxc12Q8K5B8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxc12Q8K5B8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hoxc12Q8K5B8 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxc12Q8K5B8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxc12Q8K5B8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxc12Q8K5B8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxc12Q8K5B8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxc12Q8K5B8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxc12Q8K5B8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxc12Q8K5B8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxc12Q8K5B8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Hoxc12Q8K5B8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxc12Q8K5B8 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxc12Q8K5B8 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxc12Q8K5B8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxc12Q8K5B8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxc12Q8K5B8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxc12Q8K5B8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxc12Q8K5B8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxc12Q8K5B8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxc12Q8K5B8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxc12Q8K5B8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxc12Q8K5B8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxc12Q8K5B8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxc12Q8K5B8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxc12Q8K5B8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxc12Q8K5B8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxc12Q8K5B8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxc12Q8K5B8 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxc12Q8K5B8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxc12Q8K5B8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxc12Q8K5B8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxc12Q8K5B8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxc12Q8K5B8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxc12Q8K5B8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxc12Q8K5B8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxc12Q8K5B8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms