Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3X6

Anks4b, Ankyrin repeat and SAM domain-containing protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Anks4bQ8K3X6 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Anks4bQ8K3X6 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
Anks4bQ8K3X6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Anks4bQ8K3X6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Anks4bQ8K3X6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Anks4bQ8K3X6 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Anks4bQ8K3X6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
Anks4bQ8K3X6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Anks4bQ8K3X6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Anks4bQ8K3X6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
Anks4bQ8K3X6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.34
Anks4bQ8K3X6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Anks4bQ8K3X6 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Anks4bQ8K3X6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Anks4bQ8K3X6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Anks4bQ8K3X6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Anks4bQ8K3X6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Anks4bQ8K3X6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Anks4bQ8K3X6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Anks4bQ8K3X6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Anks4bQ8K3X6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Anks4bQ8K3X6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Anks4bQ8K3X6 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Anks4bQ8K3X6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Anks4bQ8K3X6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
Anks4bQ8K3X6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Anks4bQ8K3X6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Anks4bQ8K3X6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Anks4bQ8K3X6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Anks4bQ8K3X6 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
Anks4bQ8K3X6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Anks4bQ8K3X6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC35.71■■■■□ 3.31
Anks4bQ8K3X6 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC35.69■■■■□ 3.3
Anks4bQ8K3X6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Anks4bQ8K3X6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
Anks4bQ8K3X6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Anks4bQ8K3X6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
Anks4bQ8K3X6 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC35.66■■■■□ 3.3
Anks4bQ8K3X6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Anks4bQ8K3X6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
Anks4bQ8K3X6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Anks4bQ8K3X6 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
Anks4bQ8K3X6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Anks4bQ8K3X6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Anks4bQ8K3X6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Anks4bQ8K3X6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Anks4bQ8K3X6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
Anks4bQ8K3X6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
Anks4bQ8K3X6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Anks4bQ8K3X6 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Anks4bQ8K3X6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Anks4bQ8K3X6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Anks4bQ8K3X6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Anks4bQ8K3X6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Anks4bQ8K3X6 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Anks4bQ8K3X6 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Anks4bQ8K3X6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Anks4bQ8K3X6 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Anks4bQ8K3X6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Anks4bQ8K3X6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Anks4bQ8K3X6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
Anks4bQ8K3X6 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Anks4bQ8K3X6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Anks4bQ8K3X6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Anks4bQ8K3X6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
Anks4bQ8K3X6 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
Anks4bQ8K3X6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Anks4bQ8K3X6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
Anks4bQ8K3X6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Anks4bQ8K3X6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Anks4bQ8K3X6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Anks4bQ8K3X6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
Anks4bQ8K3X6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Anks4bQ8K3X6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Anks4bQ8K3X6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
Anks4bQ8K3X6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Anks4bQ8K3X6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
Anks4bQ8K3X6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Anks4bQ8K3X6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Anks4bQ8K3X6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Anks4bQ8K3X6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Anks4bQ8K3X6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Anks4bQ8K3X6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Anks4bQ8K3X6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Anks4bQ8K3X6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Anks4bQ8K3X6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Anks4bQ8K3X6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
Anks4bQ8K3X6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Anks4bQ8K3X6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
Anks4bQ8K3X6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC35.13■■■■□ 3.21
Anks4bQ8K3X6 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
Anks4bQ8K3X6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC35.11■■■■□ 3.21
Anks4bQ8K3X6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
Anks4bQ8K3X6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Anks4bQ8K3X6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Anks4bQ8K3X6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Anks4bQ8K3X6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Anks4bQ8K3X6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Anks4bQ8K3X6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Anks4bQ8K3X6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms