Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3P5

Cnot6, CCR4-NOT transcription complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot6Q8K3P5 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cnot6Q8K3P5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cnot6Q8K3P5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cnot6Q8K3P5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cnot6Q8K3P5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cnot6Q8K3P5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cnot6Q8K3P5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cnot6Q8K3P5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cnot6Q8K3P5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cnot6Q8K3P5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Cnot6Q8K3P5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cnot6Q8K3P5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cnot6Q8K3P5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cnot6Q8K3P5 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cnot6Q8K3P5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cnot6Q8K3P5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Cnot6Q8K3P5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cnot6Q8K3P5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cnot6Q8K3P5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cnot6Q8K3P5 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cnot6Q8K3P5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cnot6Q8K3P5 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cnot6Q8K3P5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cnot6Q8K3P5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cnot6Q8K3P5 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cnot6Q8K3P5 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cnot6Q8K3P5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cnot6Q8K3P5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cnot6Q8K3P5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cnot6Q8K3P5 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cnot6Q8K3P5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cnot6Q8K3P5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cnot6Q8K3P5 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Cnot6Q8K3P5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cnot6Q8K3P5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cnot6Q8K3P5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cnot6Q8K3P5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Cnot6Q8K3P5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cnot6Q8K3P5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cnot6Q8K3P5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cnot6Q8K3P5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cnot6Q8K3P5 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Cnot6Q8K3P5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cnot6Q8K3P5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cnot6Q8K3P5 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cnot6Q8K3P5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cnot6Q8K3P5 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cnot6Q8K3P5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cnot6Q8K3P5 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cnot6Q8K3P5 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Cnot6Q8K3P5 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Cnot6Q8K3P5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cnot6Q8K3P5 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cnot6Q8K3P5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cnot6Q8K3P5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cnot6Q8K3P5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cnot6Q8K3P5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Cnot6Q8K3P5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cnot6Q8K3P5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cnot6Q8K3P5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cnot6Q8K3P5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cnot6Q8K3P5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cnot6Q8K3P5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cnot6Q8K3P5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Cnot6Q8K3P5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cnot6Q8K3P5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cnot6Q8K3P5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cnot6Q8K3P5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cnot6Q8K3P5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cnot6Q8K3P5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cnot6Q8K3P5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cnot6Q8K3P5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cnot6Q8K3P5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cnot6Q8K3P5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cnot6Q8K3P5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cnot6Q8K3P5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cnot6Q8K3P5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cnot6Q8K3P5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cnot6Q8K3P5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cnot6Q8K3P5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cnot6Q8K3P5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cnot6Q8K3P5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cnot6Q8K3P5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cnot6Q8K3P5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cnot6Q8K3P5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cnot6Q8K3P5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cnot6Q8K3P5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cnot6Q8K3P5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cnot6Q8K3P5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cnot6Q8K3P5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cnot6Q8K3P5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Cnot6Q8K3P5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cnot6Q8K3P5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cnot6Q8K3P5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Cnot6Q8K3P5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cnot6Q8K3P5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Cnot6Q8K3P5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cnot6Q8K3P5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cnot6Q8K3P5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cnot6Q8K3P5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms