Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3A0

Hscb, Iron-sulfur cluster co-chaperone protein HscB, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HscbQ8K3A0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HscbQ8K3A0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HscbQ8K3A0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HscbQ8K3A0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
HscbQ8K3A0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HscbQ8K3A0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HscbQ8K3A0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HscbQ8K3A0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HscbQ8K3A0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HscbQ8K3A0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HscbQ8K3A0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HscbQ8K3A0 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HscbQ8K3A0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HscbQ8K3A0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HscbQ8K3A0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HscbQ8K3A0 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HscbQ8K3A0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HscbQ8K3A0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HscbQ8K3A0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HscbQ8K3A0 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HscbQ8K3A0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HscbQ8K3A0 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
HscbQ8K3A0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HscbQ8K3A0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HscbQ8K3A0 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HscbQ8K3A0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HscbQ8K3A0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HscbQ8K3A0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HscbQ8K3A0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
HscbQ8K3A0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HscbQ8K3A0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HscbQ8K3A0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HscbQ8K3A0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HscbQ8K3A0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HscbQ8K3A0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HscbQ8K3A0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HscbQ8K3A0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HscbQ8K3A0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HscbQ8K3A0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HscbQ8K3A0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HscbQ8K3A0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HscbQ8K3A0 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HscbQ8K3A0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HscbQ8K3A0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HscbQ8K3A0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HscbQ8K3A0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HscbQ8K3A0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HscbQ8K3A0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HscbQ8K3A0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HscbQ8K3A0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HscbQ8K3A0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HscbQ8K3A0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
HscbQ8K3A0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HscbQ8K3A0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HscbQ8K3A0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HscbQ8K3A0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HscbQ8K3A0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HscbQ8K3A0 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HscbQ8K3A0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HscbQ8K3A0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HscbQ8K3A0 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HscbQ8K3A0 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
HscbQ8K3A0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HscbQ8K3A0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HscbQ8K3A0 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HscbQ8K3A0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HscbQ8K3A0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HscbQ8K3A0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HscbQ8K3A0 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HscbQ8K3A0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HscbQ8K3A0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
HscbQ8K3A0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HscbQ8K3A0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HscbQ8K3A0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HscbQ8K3A0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HscbQ8K3A0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HscbQ8K3A0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HscbQ8K3A0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HscbQ8K3A0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HscbQ8K3A0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HscbQ8K3A0 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HscbQ8K3A0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HscbQ8K3A0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HscbQ8K3A0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
HscbQ8K3A0 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HscbQ8K3A0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HscbQ8K3A0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HscbQ8K3A0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HscbQ8K3A0 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
HscbQ8K3A0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HscbQ8K3A0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HscbQ8K3A0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HscbQ8K3A0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HscbQ8K3A0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HscbQ8K3A0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HscbQ8K3A0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HscbQ8K3A0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HscbQ8K3A0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HscbQ8K3A0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HscbQ8K3A0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms