Protein–RNA interactions for Protein: Q8K352

Sash3, SAM and SH3 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sash3Q8K352 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sash3Q8K352 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sash3Q8K352 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sash3Q8K352 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sash3Q8K352 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Sash3Q8K352 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Sash3Q8K352 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Sash3Q8K352 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Sash3Q8K352 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Sash3Q8K352 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sash3Q8K352 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sash3Q8K352 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sash3Q8K352 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sash3Q8K352 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sash3Q8K352 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sash3Q8K352 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Sash3Q8K352 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sash3Q8K352 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Sash3Q8K352 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Sash3Q8K352 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Sash3Q8K352 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Sash3Q8K352 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Sash3Q8K352 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Sash3Q8K352 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Sash3Q8K352 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Sash3Q8K352 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Sash3Q8K352 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Sash3Q8K352 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Sash3Q8K352 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Sash3Q8K352 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sash3Q8K352 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sash3Q8K352 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Sash3Q8K352 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sash3Q8K352 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sash3Q8K352 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sash3Q8K352 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sash3Q8K352 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sash3Q8K352 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Sash3Q8K352 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Sash3Q8K352 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sash3Q8K352 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sash3Q8K352 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sash3Q8K352 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Sash3Q8K352 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Sash3Q8K352 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sash3Q8K352 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sash3Q8K352 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sash3Q8K352 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sash3Q8K352 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sash3Q8K352 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sash3Q8K352 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Sash3Q8K352 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sash3Q8K352 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sash3Q8K352 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Sash3Q8K352 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Sash3Q8K352 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Sash3Q8K352 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sash3Q8K352 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sash3Q8K352 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sash3Q8K352 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sash3Q8K352 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Sash3Q8K352 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sash3Q8K352 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Sash3Q8K352 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sash3Q8K352 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sash3Q8K352 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sash3Q8K352 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Sash3Q8K352 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Sash3Q8K352 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sash3Q8K352 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sash3Q8K352 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sash3Q8K352 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sash3Q8K352 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sash3Q8K352 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sash3Q8K352 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Sash3Q8K352 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Sash3Q8K352 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Sash3Q8K352 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sash3Q8K352 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sash3Q8K352 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sash3Q8K352 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sash3Q8K352 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sash3Q8K352 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sash3Q8K352 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sash3Q8K352 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sash3Q8K352 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sash3Q8K352 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sash3Q8K352 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sash3Q8K352 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sash3Q8K352 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sash3Q8K352 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sash3Q8K352 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sash3Q8K352 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sash3Q8K352 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sash3Q8K352 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sash3Q8K352 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sash3Q8K352 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sash3Q8K352 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sash3Q8K352 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sash3Q8K352 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms