Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2X8

Gtf2h5, General transcription factor IIH subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2h5Q8K2X8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtf2h5Q8K2X8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtf2h5Q8K2X8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtf2h5Q8K2X8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtf2h5Q8K2X8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtf2h5Q8K2X8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtf2h5Q8K2X8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gtf2h5Q8K2X8 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtf2h5Q8K2X8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gtf2h5Q8K2X8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gtf2h5Q8K2X8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gtf2h5Q8K2X8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gtf2h5Q8K2X8 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Gtf2h5Q8K2X8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gtf2h5Q8K2X8 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gtf2h5Q8K2X8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gtf2h5Q8K2X8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Gtf2h5Q8K2X8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Gtf2h5Q8K2X8 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gtf2h5Q8K2X8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gtf2h5Q8K2X8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gtf2h5Q8K2X8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gtf2h5Q8K2X8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gtf2h5Q8K2X8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gtf2h5Q8K2X8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gtf2h5Q8K2X8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gtf2h5Q8K2X8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gtf2h5Q8K2X8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Gtf2h5Q8K2X8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gtf2h5Q8K2X8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gtf2h5Q8K2X8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtf2h5Q8K2X8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtf2h5Q8K2X8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtf2h5Q8K2X8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtf2h5Q8K2X8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gtf2h5Q8K2X8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gtf2h5Q8K2X8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtf2h5Q8K2X8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf2h5Q8K2X8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf2h5Q8K2X8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf2h5Q8K2X8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf2h5Q8K2X8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtf2h5Q8K2X8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gtf2h5Q8K2X8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gtf2h5Q8K2X8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtf2h5Q8K2X8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf2h5Q8K2X8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf2h5Q8K2X8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtf2h5Q8K2X8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gtf2h5Q8K2X8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf2h5Q8K2X8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf2h5Q8K2X8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtf2h5Q8K2X8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf2h5Q8K2X8 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtf2h5Q8K2X8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtf2h5Q8K2X8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtf2h5Q8K2X8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtf2h5Q8K2X8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtf2h5Q8K2X8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtf2h5Q8K2X8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtf2h5Q8K2X8 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtf2h5Q8K2X8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtf2h5Q8K2X8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtf2h5Q8K2X8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtf2h5Q8K2X8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtf2h5Q8K2X8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtf2h5Q8K2X8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtf2h5Q8K2X8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtf2h5Q8K2X8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtf2h5Q8K2X8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtf2h5Q8K2X8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtf2h5Q8K2X8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtf2h5Q8K2X8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtf2h5Q8K2X8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gtf2h5Q8K2X8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gtf2h5Q8K2X8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gtf2h5Q8K2X8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gtf2h5Q8K2X8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtf2h5Q8K2X8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtf2h5Q8K2X8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtf2h5Q8K2X8 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtf2h5Q8K2X8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtf2h5Q8K2X8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf2h5Q8K2X8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf2h5Q8K2X8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf2h5Q8K2X8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf2h5Q8K2X8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf2h5Q8K2X8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf2h5Q8K2X8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf2h5Q8K2X8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gtf2h5Q8K2X8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf2h5Q8K2X8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2h5Q8K2X8 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2h5Q8K2X8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2h5Q8K2X8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2h5Q8K2X8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf2h5Q8K2X8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf2h5Q8K2X8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf2h5Q8K2X8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf2h5Q8K2X8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.3 ms