Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0U3

Tmem17, Transmembrane protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem17Q8K0U3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmem17Q8K0U3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmem17Q8K0U3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmem17Q8K0U3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tmem17Q8K0U3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmem17Q8K0U3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmem17Q8K0U3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmem17Q8K0U3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmem17Q8K0U3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmem17Q8K0U3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmem17Q8K0U3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmem17Q8K0U3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmem17Q8K0U3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmem17Q8K0U3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmem17Q8K0U3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmem17Q8K0U3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmem17Q8K0U3 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmem17Q8K0U3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmem17Q8K0U3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmem17Q8K0U3 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmem17Q8K0U3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmem17Q8K0U3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmem17Q8K0U3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmem17Q8K0U3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmem17Q8K0U3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmem17Q8K0U3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmem17Q8K0U3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmem17Q8K0U3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmem17Q8K0U3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmem17Q8K0U3 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmem17Q8K0U3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmem17Q8K0U3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmem17Q8K0U3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmem17Q8K0U3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmem17Q8K0U3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmem17Q8K0U3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmem17Q8K0U3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmem17Q8K0U3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmem17Q8K0U3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmem17Q8K0U3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmem17Q8K0U3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmem17Q8K0U3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem17Q8K0U3 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmem17Q8K0U3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmem17Q8K0U3 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmem17Q8K0U3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem17Q8K0U3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem17Q8K0U3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmem17Q8K0U3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmem17Q8K0U3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmem17Q8K0U3 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmem17Q8K0U3 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmem17Q8K0U3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmem17Q8K0U3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmem17Q8K0U3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem17Q8K0U3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem17Q8K0U3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmem17Q8K0U3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmem17Q8K0U3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmem17Q8K0U3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmem17Q8K0U3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem17Q8K0U3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem17Q8K0U3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmem17Q8K0U3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem17Q8K0U3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem17Q8K0U3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem17Q8K0U3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem17Q8K0U3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem17Q8K0U3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem17Q8K0U3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tmem17Q8K0U3 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem17Q8K0U3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem17Q8K0U3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmem17Q8K0U3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmem17Q8K0U3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmem17Q8K0U3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Tmem17Q8K0U3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tmem17Q8K0U3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Tmem17Q8K0U3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmem17Q8K0U3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmem17Q8K0U3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmem17Q8K0U3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmem17Q8K0U3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmem17Q8K0U3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmem17Q8K0U3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmem17Q8K0U3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmem17Q8K0U3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmem17Q8K0U3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmem17Q8K0U3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmem17Q8K0U3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmem17Q8K0U3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmem17Q8K0U3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tmem17Q8K0U3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmem17Q8K0U3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmem17Q8K0U3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmem17Q8K0U3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmem17Q8K0U3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmem17Q8K0U3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmem17Q8K0U3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmem17Q8K0U3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms