Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ91

Cd209b, CD209 antigen-like protein B, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd209bQ8CJ91 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cd209bQ8CJ91 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cd209bQ8CJ91 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cd209bQ8CJ91 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cd209bQ8CJ91 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cd209bQ8CJ91 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cd209bQ8CJ91 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cd209bQ8CJ91 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cd209bQ8CJ91 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cd209bQ8CJ91 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cd209bQ8CJ91 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cd209bQ8CJ91 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cd209bQ8CJ91 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cd209bQ8CJ91 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cd209bQ8CJ91 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cd209bQ8CJ91 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cd209bQ8CJ91 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cd209bQ8CJ91 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cd209bQ8CJ91 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cd209bQ8CJ91 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cd209bQ8CJ91 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cd209bQ8CJ91 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cd209bQ8CJ91 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cd209bQ8CJ91 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cd209bQ8CJ91 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cd209bQ8CJ91 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cd209bQ8CJ91 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Cd209bQ8CJ91 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cd209bQ8CJ91 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Cd209bQ8CJ91 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cd209bQ8CJ91 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cd209bQ8CJ91 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cd209bQ8CJ91 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cd209bQ8CJ91 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cd209bQ8CJ91 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cd209bQ8CJ91 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cd209bQ8CJ91 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cd209bQ8CJ91 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cd209bQ8CJ91 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cd209bQ8CJ91 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cd209bQ8CJ91 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cd209bQ8CJ91 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cd209bQ8CJ91 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cd209bQ8CJ91 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cd209bQ8CJ91 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cd209bQ8CJ91 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cd209bQ8CJ91 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cd209bQ8CJ91 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cd209bQ8CJ91 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cd209bQ8CJ91 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cd209bQ8CJ91 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cd209bQ8CJ91 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cd209bQ8CJ91 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cd209bQ8CJ91 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cd209bQ8CJ91 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Cd209bQ8CJ91 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Cd209bQ8CJ91 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cd209bQ8CJ91 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cd209bQ8CJ91 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cd209bQ8CJ91 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cd209bQ8CJ91 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cd209bQ8CJ91 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cd209bQ8CJ91 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cd209bQ8CJ91 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Cd209bQ8CJ91 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cd209bQ8CJ91 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cd209bQ8CJ91 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cd209bQ8CJ91 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cd209bQ8CJ91 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cd209bQ8CJ91 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Cd209bQ8CJ91 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cd209bQ8CJ91 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cd209bQ8CJ91 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Cd209bQ8CJ91 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cd209bQ8CJ91 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cd209bQ8CJ91 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cd209bQ8CJ91 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Cd209bQ8CJ91 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cd209bQ8CJ91 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cd209bQ8CJ91 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cd209bQ8CJ91 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cd209bQ8CJ91 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cd209bQ8CJ91 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Cd209bQ8CJ91 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Cd209bQ8CJ91 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Cd209bQ8CJ91 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cd209bQ8CJ91 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cd209bQ8CJ91 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cd209bQ8CJ91 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cd209bQ8CJ91 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cd209bQ8CJ91 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cd209bQ8CJ91 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cd209bQ8CJ91 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cd209bQ8CJ91 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Cd209bQ8CJ91 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Cd209bQ8CJ91 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cd209bQ8CJ91 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cd209bQ8CJ91 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cd209bQ8CJ91 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cd209bQ8CJ91 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms