Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Znf628Q8CJ78 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Znf628Q8CJ78 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Znf628Q8CJ78 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Znf628Q8CJ78 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Znf628Q8CJ78 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Znf628Q8CJ78 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Znf628Q8CJ78 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Znf628Q8CJ78 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Znf628Q8CJ78 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Znf628Q8CJ78 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Znf628Q8CJ78 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Znf628Q8CJ78 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Znf628Q8CJ78 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Znf628Q8CJ78 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Znf628Q8CJ78 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Znf628Q8CJ78 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Znf628Q8CJ78 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Znf628Q8CJ78 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Znf628Q8CJ78 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Znf628Q8CJ78 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Znf628Q8CJ78 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Znf628Q8CJ78 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Znf628Q8CJ78 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Znf628Q8CJ78 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Znf628Q8CJ78 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Znf628Q8CJ78 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Znf628Q8CJ78 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Znf628Q8CJ78 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Znf628Q8CJ78 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Znf628Q8CJ78 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Znf628Q8CJ78 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Znf628Q8CJ78 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Znf628Q8CJ78 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Znf628Q8CJ78 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Znf628Q8CJ78 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Znf628Q8CJ78 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Znf628Q8CJ78 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Znf628Q8CJ78 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Znf628Q8CJ78 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Znf628Q8CJ78 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Znf628Q8CJ78 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Znf628Q8CJ78 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Znf628Q8CJ78 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Znf628Q8CJ78 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Znf628Q8CJ78 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Znf628Q8CJ78 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Znf628Q8CJ78 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Znf628Q8CJ78 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Znf628Q8CJ78 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Znf628Q8CJ78 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Znf628Q8CJ78 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Znf628Q8CJ78 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Znf628Q8CJ78 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Znf628Q8CJ78 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Znf628Q8CJ78 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Znf628Q8CJ78 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Znf628Q8CJ78 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Znf628Q8CJ78 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Znf628Q8CJ78 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Znf628Q8CJ78 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Znf628Q8CJ78 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Znf628Q8CJ78 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Znf628Q8CJ78 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Znf628Q8CJ78 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Znf628Q8CJ78 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Znf628Q8CJ78 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Znf628Q8CJ78 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Znf628Q8CJ78 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Znf628Q8CJ78 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Znf628Q8CJ78 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Znf628Q8CJ78 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Znf628Q8CJ78 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Znf628Q8CJ78 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Znf628Q8CJ78 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Znf628Q8CJ78 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Znf628Q8CJ78 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Znf628Q8CJ78 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Znf628Q8CJ78 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Znf628Q8CJ78 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Znf628Q8CJ78 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Znf628Q8CJ78 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Znf628Q8CJ78 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Znf628Q8CJ78 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Znf628Q8CJ78 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Znf628Q8CJ78 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Znf628Q8CJ78 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Znf628Q8CJ78 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Znf628Q8CJ78 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Znf628Q8CJ78 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Znf628Q8CJ78 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Znf628Q8CJ78 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Znf628Q8CJ78 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Znf628Q8CJ78 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Znf628Q8CJ78 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Znf628Q8CJ78 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Znf628Q8CJ78 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Znf628Q8CJ78 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Znf628Q8CJ78 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Znf628Q8CJ78 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.4 ms