Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LgsnQ8CIX8 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LgsnQ8CIX8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
LgsnQ8CIX8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LgsnQ8CIX8 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LgsnQ8CIX8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LgsnQ8CIX8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LgsnQ8CIX8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LgsnQ8CIX8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LgsnQ8CIX8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LgsnQ8CIX8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LgsnQ8CIX8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LgsnQ8CIX8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LgsnQ8CIX8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LgsnQ8CIX8 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LgsnQ8CIX8 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LgsnQ8CIX8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LgsnQ8CIX8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
LgsnQ8CIX8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LgsnQ8CIX8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LgsnQ8CIX8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LgsnQ8CIX8 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LgsnQ8CIX8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
LgsnQ8CIX8 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LgsnQ8CIX8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
LgsnQ8CIX8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LgsnQ8CIX8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LgsnQ8CIX8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LgsnQ8CIX8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LgsnQ8CIX8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LgsnQ8CIX8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
LgsnQ8CIX8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LgsnQ8CIX8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LgsnQ8CIX8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LgsnQ8CIX8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LgsnQ8CIX8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LgsnQ8CIX8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LgsnQ8CIX8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LgsnQ8CIX8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LgsnQ8CIX8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LgsnQ8CIX8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LgsnQ8CIX8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LgsnQ8CIX8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LgsnQ8CIX8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LgsnQ8CIX8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
LgsnQ8CIX8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LgsnQ8CIX8 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LgsnQ8CIX8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LgsnQ8CIX8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
LgsnQ8CIX8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LgsnQ8CIX8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LgsnQ8CIX8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LgsnQ8CIX8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LgsnQ8CIX8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LgsnQ8CIX8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LgsnQ8CIX8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LgsnQ8CIX8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LgsnQ8CIX8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LgsnQ8CIX8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LgsnQ8CIX8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LgsnQ8CIX8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LgsnQ8CIX8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LgsnQ8CIX8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LgsnQ8CIX8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LgsnQ8CIX8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LgsnQ8CIX8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LgsnQ8CIX8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LgsnQ8CIX8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LgsnQ8CIX8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LgsnQ8CIX8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LgsnQ8CIX8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
LgsnQ8CIX8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LgsnQ8CIX8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
LgsnQ8CIX8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
LgsnQ8CIX8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LgsnQ8CIX8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LgsnQ8CIX8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
LgsnQ8CIX8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LgsnQ8CIX8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LgsnQ8CIX8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LgsnQ8CIX8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LgsnQ8CIX8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LgsnQ8CIX8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LgsnQ8CIX8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LgsnQ8CIX8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
LgsnQ8CIX8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LgsnQ8CIX8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LgsnQ8CIX8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LgsnQ8CIX8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LgsnQ8CIX8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
LgsnQ8CIX8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LgsnQ8CIX8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LgsnQ8CIX8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
LgsnQ8CIX8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LgsnQ8CIX8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LgsnQ8CIX8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
LgsnQ8CIX8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LgsnQ8CIX8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LgsnQ8CIX8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LgsnQ8CIX8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms