Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIL4

Uncharacterized protein C1orf131 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8CIL4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Q8CIL4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Q8CIL4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Q8CIL4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Q8CIL4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Q8CIL4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Q8CIL4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Q8CIL4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Q8CIL4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Q8CIL4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Q8CIL4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Q8CIL4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Q8CIL4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Q8CIL4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Q8CIL4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Q8CIL4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Q8CIL4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Q8CIL4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Q8CIL4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Q8CIL4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Q8CIL4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Q8CIL4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Q8CIL4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Q8CIL4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Q8CIL4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Q8CIL4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Q8CIL4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Q8CIL4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Q8CIL4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Q8CIL4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Q8CIL4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Q8CIL4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Q8CIL4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Q8CIL4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Q8CIL4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Q8CIL4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Q8CIL4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Q8CIL4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Q8CIL4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Q8CIL4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Q8CIL4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Q8CIL4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Q8CIL4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Q8CIL4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Q8CIL4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Q8CIL4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Q8CIL4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Q8CIL4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Q8CIL4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Q8CIL4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Q8CIL4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Q8CIL4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Q8CIL4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Q8CIL4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Q8CIL4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Q8CIL4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Q8CIL4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Q8CIL4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Q8CIL4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Q8CIL4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Q8CIL4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Q8CIL4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Q8CIL4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Q8CIL4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Q8CIL4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Q8CIL4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Q8CIL4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Q8CIL4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Q8CIL4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Q8CIL4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Q8CIL4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Q8CIL4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Q8CIL4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Q8CIL4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Q8CIL4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Q8CIL4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Q8CIL4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Q8CIL4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Q8CIL4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Q8CIL4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Q8CIL4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Q8CIL4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Q8CIL4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Q8CIL4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Q8CIL4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Q8CIL4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Q8CIL4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Q8CIL4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Q8CIL4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Q8CIL4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Q8CIL4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Q8CIL4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Q8CIL4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Q8CIL4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Q8CIL4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Q8CIL4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Q8CIL4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Q8CIL4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Q8CIL4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Q8CIL4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9 ms