Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG5

Ccdc28b, Coiled-coil domain-containing protein 28B, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28bQ8CEG5 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc28bQ8CEG5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc28bQ8CEG5 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc28bQ8CEG5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc28bQ8CEG5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc28bQ8CEG5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc28bQ8CEG5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc28bQ8CEG5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc28bQ8CEG5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc28bQ8CEG5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc28bQ8CEG5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc28bQ8CEG5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc28bQ8CEG5 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc28bQ8CEG5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc28bQ8CEG5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc28bQ8CEG5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc28bQ8CEG5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc28bQ8CEG5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc28bQ8CEG5 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc28bQ8CEG5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc28bQ8CEG5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc28bQ8CEG5 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc28bQ8CEG5 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc28bQ8CEG5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc28bQ8CEG5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc28bQ8CEG5 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc28bQ8CEG5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc28bQ8CEG5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc28bQ8CEG5 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc28bQ8CEG5 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc28bQ8CEG5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc28bQ8CEG5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc28bQ8CEG5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc28bQ8CEG5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc28bQ8CEG5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc28bQ8CEG5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc28bQ8CEG5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc28bQ8CEG5 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc28bQ8CEG5 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc28bQ8CEG5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc28bQ8CEG5 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc28bQ8CEG5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc28bQ8CEG5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc28bQ8CEG5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc28bQ8CEG5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc28bQ8CEG5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc28bQ8CEG5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc28bQ8CEG5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc28bQ8CEG5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc28bQ8CEG5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc28bQ8CEG5 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc28bQ8CEG5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc28bQ8CEG5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc28bQ8CEG5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc28bQ8CEG5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc28bQ8CEG5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc28bQ8CEG5 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc28bQ8CEG5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc28bQ8CEG5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc28bQ8CEG5 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc28bQ8CEG5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc28bQ8CEG5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc28bQ8CEG5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc28bQ8CEG5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc28bQ8CEG5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc28bQ8CEG5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc28bQ8CEG5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc28bQ8CEG5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc28bQ8CEG5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ccdc28bQ8CEG5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc28bQ8CEG5 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc28bQ8CEG5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc28bQ8CEG5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc28bQ8CEG5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc28bQ8CEG5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc28bQ8CEG5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc28bQ8CEG5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc28bQ8CEG5 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc28bQ8CEG5 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc28bQ8CEG5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc28bQ8CEG5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc28bQ8CEG5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc28bQ8CEG5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc28bQ8CEG5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc28bQ8CEG5 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc28bQ8CEG5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc28bQ8CEG5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc28bQ8CEG5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc28bQ8CEG5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc28bQ8CEG5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc28bQ8CEG5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc28bQ8CEG5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc28bQ8CEG5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc28bQ8CEG5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc28bQ8CEG5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc28bQ8CEG5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc28bQ8CEG5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc28bQ8CEG5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc28bQ8CEG5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc28bQ8CEG5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1032.6 ms