Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
Lrrc9Q8CDN9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
Lrrc9Q8CDN9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC41.74■■■■■ 4.27
Lrrc9Q8CDN9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC41.71■■■■■ 4.27
Lrrc9Q8CDN9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
Lrrc9Q8CDN9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
Lrrc9Q8CDN9 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
Lrrc9Q8CDN9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC41.7■■■■■ 4.27
Lrrc9Q8CDN9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
Lrrc9Q8CDN9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.67■■■■■ 4.26
Lrrc9Q8CDN9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC41.65■■■■■ 4.26
Lrrc9Q8CDN9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
Lrrc9Q8CDN9 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
Lrrc9Q8CDN9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
Lrrc9Q8CDN9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.56■■■■■ 4.24
Lrrc9Q8CDN9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
Lrrc9Q8CDN9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC41.55■■■■■ 4.24
Lrrc9Q8CDN9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC41.54■■■■■ 4.24
Lrrc9Q8CDN9 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
Lrrc9Q8CDN9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
Lrrc9Q8CDN9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
Lrrc9Q8CDN9 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.46■■■■■ 4.23
Lrrc9Q8CDN9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.44■■■■■ 4.22
Lrrc9Q8CDN9 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC41.43■■■■■ 4.22
Lrrc9Q8CDN9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
Lrrc9Q8CDN9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
Lrrc9Q8CDN9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.41■■■■■ 4.22
Lrrc9Q8CDN9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
Lrrc9Q8CDN9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
Lrrc9Q8CDN9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
Lrrc9Q8CDN9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
Lrrc9Q8CDN9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
Lrrc9Q8CDN9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC41.34■■■■■ 4.21
Lrrc9Q8CDN9 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC41.34■■■■■ 4.21
Lrrc9Q8CDN9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
Lrrc9Q8CDN9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC41.32■■■■■ 4.21
Lrrc9Q8CDN9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC41.31■■■■■ 4.2
Lrrc9Q8CDN9 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
Lrrc9Q8CDN9 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC41.27■■■■■ 4.2
Lrrc9Q8CDN9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
Lrrc9Q8CDN9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
Lrrc9Q8CDN9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC41.26■■■■■ 4.2
Lrrc9Q8CDN9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC41.26■■■■■ 4.2
Lrrc9Q8CDN9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
Lrrc9Q8CDN9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC41.15■■■■■ 4.18
Lrrc9Q8CDN9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
Lrrc9Q8CDN9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.18
Lrrc9Q8CDN9 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
Lrrc9Q8CDN9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
Lrrc9Q8CDN9 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
Lrrc9Q8CDN9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC41.03■■■■■ 4.16
Lrrc9Q8CDN9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
Lrrc9Q8CDN9 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
Lrrc9Q8CDN9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC41.02■■■■■ 4.16
Lrrc9Q8CDN9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC41.01■■■■■ 4.16
Lrrc9Q8CDN9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC40.98■■■■■ 4.15
Lrrc9Q8CDN9 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
Lrrc9Q8CDN9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC40.96■■■■■ 4.15
Lrrc9Q8CDN9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC40.95■■■■■ 4.15
Lrrc9Q8CDN9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.94■■■■■ 4.14
Lrrc9Q8CDN9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC40.88■■■■■ 4.13
Lrrc9Q8CDN9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC40.87■■■■■ 4.13
Lrrc9Q8CDN9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
Lrrc9Q8CDN9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC40.84■■■■■ 4.13
Lrrc9Q8CDN9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.83■■■■■ 4.13
Lrrc9Q8CDN9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC40.82■■■■■ 4.12
Lrrc9Q8CDN9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC40.77■■■■■ 4.12
Lrrc9Q8CDN9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
Lrrc9Q8CDN9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
Lrrc9Q8CDN9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
Lrrc9Q8CDN9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
Lrrc9Q8CDN9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
Lrrc9Q8CDN9 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
Lrrc9Q8CDN9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
Lrrc9Q8CDN9 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
Lrrc9Q8CDN9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.57■■■■■ 4.08
Lrrc9Q8CDN9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
Lrrc9Q8CDN9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
Lrrc9Q8CDN9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
Lrrc9Q8CDN9 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC40.51■■■■■ 4.08
Lrrc9Q8CDN9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC40.45■■■■■ 4.07
Lrrc9Q8CDN9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
Lrrc9Q8CDN9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC40.41■■■■■ 4.06
Lrrc9Q8CDN9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
Lrrc9Q8CDN9 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
Lrrc9Q8CDN9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
Lrrc9Q8CDN9 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
Lrrc9Q8CDN9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.3■■■■■ 4.04
Lrrc9Q8CDN9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC40.28■■■■■ 4.04
Lrrc9Q8CDN9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
Lrrc9Q8CDN9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.03
Lrrc9Q8CDN9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC40.24■■■■■ 4.03
Lrrc9Q8CDN9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
Lrrc9Q8CDN9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
Lrrc9Q8CDN9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
Lrrc9Q8CDN9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
Lrrc9Q8CDN9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC40.2■■■■■ 4.03
Lrrc9Q8CDN9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC40.19■■■■■ 4.03
Lrrc9Q8CDN9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.16■■■■■ 4.02
Lrrc9Q8CDN9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms