Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD94

Lin52, Protein lin-52 homolog, mousemouse

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Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin52Q8CD94 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lin52Q8CD94 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lin52Q8CD94 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lin52Q8CD94 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lin52Q8CD94 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lin52Q8CD94 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lin52Q8CD94 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lin52Q8CD94 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lin52Q8CD94 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lin52Q8CD94 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lin52Q8CD94 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Lin52Q8CD94 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lin52Q8CD94 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lin52Q8CD94 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lin52Q8CD94 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lin52Q8CD94 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lin52Q8CD94 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lin52Q8CD94 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lin52Q8CD94 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lin52Q8CD94 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lin52Q8CD94 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lin52Q8CD94 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lin52Q8CD94 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lin52Q8CD94 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lin52Q8CD94 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lin52Q8CD94 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Lin52Q8CD94 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Lin52Q8CD94 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lin52Q8CD94 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lin52Q8CD94 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lin52Q8CD94 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lin52Q8CD94 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lin52Q8CD94 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lin52Q8CD94 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lin52Q8CD94 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lin52Q8CD94 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Lin52Q8CD94 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lin52Q8CD94 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lin52Q8CD94 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lin52Q8CD94 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lin52Q8CD94 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lin52Q8CD94 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lin52Q8CD94 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lin52Q8CD94 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Lin52Q8CD94 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Lin52Q8CD94 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lin52Q8CD94 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lin52Q8CD94 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lin52Q8CD94 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lin52Q8CD94 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lin52Q8CD94 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lin52Q8CD94 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lin52Q8CD94 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lin52Q8CD94 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lin52Q8CD94 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lin52Q8CD94 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lin52Q8CD94 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lin52Q8CD94 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lin52Q8CD94 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lin52Q8CD94 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lin52Q8CD94 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Lin52Q8CD94 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Lin52Q8CD94 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lin52Q8CD94 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lin52Q8CD94 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lin52Q8CD94 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lin52Q8CD94 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lin52Q8CD94 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lin52Q8CD94 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lin52Q8CD94 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lin52Q8CD94 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lin52Q8CD94 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lin52Q8CD94 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lin52Q8CD94 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Lin52Q8CD94 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lin52Q8CD94 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lin52Q8CD94 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lin52Q8CD94 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lin52Q8CD94 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lin52Q8CD94 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lin52Q8CD94 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lin52Q8CD94 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lin52Q8CD94 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lin52Q8CD94 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Lin52Q8CD94 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lin52Q8CD94 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lin52Q8CD94 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lin52Q8CD94 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lin52Q8CD94 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lin52Q8CD94 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lin52Q8CD94 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lin52Q8CD94 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lin52Q8CD94 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Lin52Q8CD94 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lin52Q8CD94 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lin52Q8CD94 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lin52Q8CD94 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lin52Q8CD94 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lin52Q8CD94 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lin52Q8CD94 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
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