Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC62

Teddm1b, MCG53738, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Teddm1bQ8CC62 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Teddm1bQ8CC62 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Teddm1bQ8CC62 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Teddm1bQ8CC62 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Teddm1bQ8CC62 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Teddm1bQ8CC62 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Teddm1bQ8CC62 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Teddm1bQ8CC62 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Teddm1bQ8CC62 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Teddm1bQ8CC62 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Teddm1bQ8CC62 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Teddm1bQ8CC62 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Teddm1bQ8CC62 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Teddm1bQ8CC62 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Teddm1bQ8CC62 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Teddm1bQ8CC62 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Teddm1bQ8CC62 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Teddm1bQ8CC62 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Teddm1bQ8CC62 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Teddm1bQ8CC62 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Teddm1bQ8CC62 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Teddm1bQ8CC62 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Teddm1bQ8CC62 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Teddm1bQ8CC62 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Teddm1bQ8CC62 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Teddm1bQ8CC62 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Teddm1bQ8CC62 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Teddm1bQ8CC62 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Teddm1bQ8CC62 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Teddm1bQ8CC62 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Teddm1bQ8CC62 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Teddm1bQ8CC62 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Teddm1bQ8CC62 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Teddm1bQ8CC62 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Teddm1bQ8CC62 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Teddm1bQ8CC62 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Teddm1bQ8CC62 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Teddm1bQ8CC62 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Teddm1bQ8CC62 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Teddm1bQ8CC62 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Teddm1bQ8CC62 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Teddm1bQ8CC62 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Teddm1bQ8CC62 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Teddm1bQ8CC62 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Teddm1bQ8CC62 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Teddm1bQ8CC62 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Teddm1bQ8CC62 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Teddm1bQ8CC62 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Teddm1bQ8CC62 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Teddm1bQ8CC62 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Teddm1bQ8CC62 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Teddm1bQ8CC62 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Teddm1bQ8CC62 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Teddm1bQ8CC62 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Teddm1bQ8CC62 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Teddm1bQ8CC62 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Teddm1bQ8CC62 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Teddm1bQ8CC62 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Teddm1bQ8CC62 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Teddm1bQ8CC62 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Teddm1bQ8CC62 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Teddm1bQ8CC62 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Teddm1bQ8CC62 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Teddm1bQ8CC62 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Teddm1bQ8CC62 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Teddm1bQ8CC62 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Teddm1bQ8CC62 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Teddm1bQ8CC62 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Teddm1bQ8CC62 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Teddm1bQ8CC62 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Teddm1bQ8CC62 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Teddm1bQ8CC62 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Teddm1bQ8CC62 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Teddm1bQ8CC62 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Teddm1bQ8CC62 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Teddm1bQ8CC62 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Teddm1bQ8CC62 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Teddm1bQ8CC62 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Teddm1bQ8CC62 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Teddm1bQ8CC62 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Teddm1bQ8CC62 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Teddm1bQ8CC62 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Teddm1bQ8CC62 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Teddm1bQ8CC62 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Teddm1bQ8CC62 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Teddm1bQ8CC62 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Teddm1bQ8CC62 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Teddm1bQ8CC62 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Teddm1bQ8CC62 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Teddm1bQ8CC62 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Teddm1bQ8CC62 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Teddm1bQ8CC62 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Teddm1bQ8CC62 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Teddm1bQ8CC62 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Teddm1bQ8CC62 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Teddm1bQ8CC62 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Teddm1bQ8CC62 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Teddm1bQ8CC62 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Teddm1bQ8CC62 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Teddm1bQ8CC62 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms