Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7W7

Dclre1b, 5' exonuclease Apollo, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclre1bQ8C7W7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Dclre1bQ8C7W7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Dclre1bQ8C7W7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Dclre1bQ8C7W7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Dclre1bQ8C7W7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Dclre1bQ8C7W7 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Dclre1bQ8C7W7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Dclre1bQ8C7W7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Dclre1bQ8C7W7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Dclre1bQ8C7W7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Dclre1bQ8C7W7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Dclre1bQ8C7W7 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Dclre1bQ8C7W7 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Dclre1bQ8C7W7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Dclre1bQ8C7W7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Dclre1bQ8C7W7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Dclre1bQ8C7W7 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Dclre1bQ8C7W7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Dclre1bQ8C7W7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Dclre1bQ8C7W7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Dclre1bQ8C7W7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Dclre1bQ8C7W7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Dclre1bQ8C7W7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Dclre1bQ8C7W7 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Dclre1bQ8C7W7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Dclre1bQ8C7W7 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Dclre1bQ8C7W7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Dclre1bQ8C7W7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Dclre1bQ8C7W7 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Dclre1bQ8C7W7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Dclre1bQ8C7W7 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Dclre1bQ8C7W7 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Dclre1bQ8C7W7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Dclre1bQ8C7W7 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Dclre1bQ8C7W7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Dclre1bQ8C7W7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Dclre1bQ8C7W7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Dclre1bQ8C7W7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Dclre1bQ8C7W7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Dclre1bQ8C7W7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Dclre1bQ8C7W7 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Dclre1bQ8C7W7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Dclre1bQ8C7W7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Dclre1bQ8C7W7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Dclre1bQ8C7W7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Dclre1bQ8C7W7 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Dclre1bQ8C7W7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Dclre1bQ8C7W7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Dclre1bQ8C7W7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Dclre1bQ8C7W7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Dclre1bQ8C7W7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Dclre1bQ8C7W7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Dclre1bQ8C7W7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Dclre1bQ8C7W7 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Dclre1bQ8C7W7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Dclre1bQ8C7W7 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Dclre1bQ8C7W7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Dclre1bQ8C7W7 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Dclre1bQ8C7W7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Dclre1bQ8C7W7 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Dclre1bQ8C7W7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Dclre1bQ8C7W7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Dclre1bQ8C7W7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Dclre1bQ8C7W7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Dclre1bQ8C7W7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Dclre1bQ8C7W7 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Dclre1bQ8C7W7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Dclre1bQ8C7W7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Dclre1bQ8C7W7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Dclre1bQ8C7W7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Dclre1bQ8C7W7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Dclre1bQ8C7W7 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Dclre1bQ8C7W7 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Dclre1bQ8C7W7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Dclre1bQ8C7W7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Dclre1bQ8C7W7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Dclre1bQ8C7W7 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Dclre1bQ8C7W7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Dclre1bQ8C7W7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Dclre1bQ8C7W7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Dclre1bQ8C7W7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Dclre1bQ8C7W7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Dclre1bQ8C7W7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Dclre1bQ8C7W7 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Dclre1bQ8C7W7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Dclre1bQ8C7W7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Dclre1bQ8C7W7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Dclre1bQ8C7W7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Dclre1bQ8C7W7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Dclre1bQ8C7W7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Dclre1bQ8C7W7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Dclre1bQ8C7W7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Dclre1bQ8C7W7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Dclre1bQ8C7W7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Dclre1bQ8C7W7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Dclre1bQ8C7W7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Dclre1bQ8C7W7 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Dclre1bQ8C7W7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Dclre1bQ8C7W7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Dclre1bQ8C7W7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.8 ms