Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1N8

Defa22, Alpha-defensin 22, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa22Q8C1N8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Defa22Q8C1N8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Defa22Q8C1N8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Defa22Q8C1N8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Defa22Q8C1N8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Defa22Q8C1N8 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Defa22Q8C1N8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Defa22Q8C1N8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Defa22Q8C1N8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Defa22Q8C1N8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Defa22Q8C1N8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Defa22Q8C1N8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Defa22Q8C1N8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Defa22Q8C1N8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Defa22Q8C1N8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Defa22Q8C1N8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Defa22Q8C1N8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Defa22Q8C1N8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Defa22Q8C1N8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Defa22Q8C1N8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Defa22Q8C1N8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Defa22Q8C1N8 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Defa22Q8C1N8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Defa22Q8C1N8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Defa22Q8C1N8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Defa22Q8C1N8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Defa22Q8C1N8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Defa22Q8C1N8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Defa22Q8C1N8 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Defa22Q8C1N8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Defa22Q8C1N8 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Defa22Q8C1N8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Defa22Q8C1N8 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Defa22Q8C1N8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Defa22Q8C1N8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Defa22Q8C1N8 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Defa22Q8C1N8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Defa22Q8C1N8 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Defa22Q8C1N8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Defa22Q8C1N8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Defa22Q8C1N8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Defa22Q8C1N8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Defa22Q8C1N8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Defa22Q8C1N8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Defa22Q8C1N8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Defa22Q8C1N8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Defa22Q8C1N8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Defa22Q8C1N8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Defa22Q8C1N8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Defa22Q8C1N8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Defa22Q8C1N8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Defa22Q8C1N8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Defa22Q8C1N8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Defa22Q8C1N8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Defa22Q8C1N8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Defa22Q8C1N8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Defa22Q8C1N8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Defa22Q8C1N8 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Defa22Q8C1N8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Defa22Q8C1N8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Defa22Q8C1N8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Defa22Q8C1N8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Defa22Q8C1N8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Defa22Q8C1N8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Defa22Q8C1N8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Defa22Q8C1N8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Defa22Q8C1N8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Defa22Q8C1N8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Defa22Q8C1N8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Defa22Q8C1N8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Defa22Q8C1N8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Defa22Q8C1N8 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Defa22Q8C1N8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Defa22Q8C1N8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Defa22Q8C1N8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Defa22Q8C1N8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Defa22Q8C1N8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Defa22Q8C1N8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Defa22Q8C1N8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Defa22Q8C1N8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Defa22Q8C1N8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Defa22Q8C1N8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Defa22Q8C1N8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Defa22Q8C1N8 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Defa22Q8C1N8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Defa22Q8C1N8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Defa22Q8C1N8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Defa22Q8C1N8 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Defa22Q8C1N8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Defa22Q8C1N8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Defa22Q8C1N8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Defa22Q8C1N8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Defa22Q8C1N8 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Defa22Q8C1N8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Defa22Q8C1N8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Defa22Q8C1N8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Defa22Q8C1N8 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Defa22Q8C1N8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Defa22Q8C1N8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Defa22Q8C1N8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.9 ms