Protein–RNA interactions for Protein: Q8C050

Rps6ka5, Ribosomal protein S6 kinase alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka5Q8C050 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rps6ka5Q8C050 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rps6ka5Q8C050 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rps6ka5Q8C050 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rps6ka5Q8C050 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rps6ka5Q8C050 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rps6ka5Q8C050 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Rps6ka5Q8C050 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Rps6ka5Q8C050 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rps6ka5Q8C050 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rps6ka5Q8C050 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rps6ka5Q8C050 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rps6ka5Q8C050 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rps6ka5Q8C050 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Rps6ka5Q8C050 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rps6ka5Q8C050 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rps6ka5Q8C050 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rps6ka5Q8C050 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rps6ka5Q8C050 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rps6ka5Q8C050 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rps6ka5Q8C050 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rps6ka5Q8C050 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rps6ka5Q8C050 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rps6ka5Q8C050 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rps6ka5Q8C050 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rps6ka5Q8C050 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rps6ka5Q8C050 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rps6ka5Q8C050 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rps6ka5Q8C050 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rps6ka5Q8C050 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Rps6ka5Q8C050 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rps6ka5Q8C050 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rps6ka5Q8C050 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rps6ka5Q8C050 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Rps6ka5Q8C050 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rps6ka5Q8C050 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rps6ka5Q8C050 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rps6ka5Q8C050 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rps6ka5Q8C050 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rps6ka5Q8C050 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rps6ka5Q8C050 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rps6ka5Q8C050 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rps6ka5Q8C050 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rps6ka5Q8C050 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rps6ka5Q8C050 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rps6ka5Q8C050 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rps6ka5Q8C050 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rps6ka5Q8C050 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rps6ka5Q8C050 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rps6ka5Q8C050 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rps6ka5Q8C050 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rps6ka5Q8C050 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rps6ka5Q8C050 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rps6ka5Q8C050 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Rps6ka5Q8C050 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rps6ka5Q8C050 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rps6ka5Q8C050 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rps6ka5Q8C050 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rps6ka5Q8C050 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rps6ka5Q8C050 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rps6ka5Q8C050 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Rps6ka5Q8C050 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rps6ka5Q8C050 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rps6ka5Q8C050 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rps6ka5Q8C050 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rps6ka5Q8C050 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rps6ka5Q8C050 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rps6ka5Q8C050 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rps6ka5Q8C050 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rps6ka5Q8C050 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Rps6ka5Q8C050 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rps6ka5Q8C050 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Rps6ka5Q8C050 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rps6ka5Q8C050 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rps6ka5Q8C050 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rps6ka5Q8C050 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rps6ka5Q8C050 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rps6ka5Q8C050 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rps6ka5Q8C050 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rps6ka5Q8C050 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rps6ka5Q8C050 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rps6ka5Q8C050 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rps6ka5Q8C050 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rps6ka5Q8C050 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rps6ka5Q8C050 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rps6ka5Q8C050 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rps6ka5Q8C050 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rps6ka5Q8C050 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Rps6ka5Q8C050 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rps6ka5Q8C050 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rps6ka5Q8C050 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rps6ka5Q8C050 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rps6ka5Q8C050 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rps6ka5Q8C050 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rps6ka5Q8C050 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rps6ka5Q8C050 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rps6ka5Q8C050 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rps6ka5Q8C050 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rps6ka5Q8C050 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rps6ka5Q8C050 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms