Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY89

Slc44a2, Choline transporter-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a2Q8BY89 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Slc44a2Q8BY89 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Slc44a2Q8BY89 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Slc44a2Q8BY89 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slc44a2Q8BY89 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slc44a2Q8BY89 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slc44a2Q8BY89 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Slc44a2Q8BY89 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Slc44a2Q8BY89 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Slc44a2Q8BY89 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Slc44a2Q8BY89 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Slc44a2Q8BY89 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Slc44a2Q8BY89 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Slc44a2Q8BY89 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Slc44a2Q8BY89 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Slc44a2Q8BY89 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Slc44a2Q8BY89 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Slc44a2Q8BY89 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Slc44a2Q8BY89 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Slc44a2Q8BY89 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Slc44a2Q8BY89 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Slc44a2Q8BY89 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Slc44a2Q8BY89 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Slc44a2Q8BY89 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Slc44a2Q8BY89 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Slc44a2Q8BY89 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Slc44a2Q8BY89 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Slc44a2Q8BY89 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Slc44a2Q8BY89 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Slc44a2Q8BY89 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slc44a2Q8BY89 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slc44a2Q8BY89 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slc44a2Q8BY89 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slc44a2Q8BY89 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slc44a2Q8BY89 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slc44a2Q8BY89 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slc44a2Q8BY89 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slc44a2Q8BY89 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slc44a2Q8BY89 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slc44a2Q8BY89 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slc44a2Q8BY89 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slc44a2Q8BY89 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slc44a2Q8BY89 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slc44a2Q8BY89 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slc44a2Q8BY89 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slc44a2Q8BY89 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slc44a2Q8BY89 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Slc44a2Q8BY89 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Slc44a2Q8BY89 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slc44a2Q8BY89 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slc44a2Q8BY89 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Slc44a2Q8BY89 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slc44a2Q8BY89 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slc44a2Q8BY89 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slc44a2Q8BY89 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Slc44a2Q8BY89 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slc44a2Q8BY89 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slc44a2Q8BY89 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc44a2Q8BY89 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc44a2Q8BY89 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc44a2Q8BY89 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slc44a2Q8BY89 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slc44a2Q8BY89 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slc44a2Q8BY89 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slc44a2Q8BY89 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slc44a2Q8BY89 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slc44a2Q8BY89 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slc44a2Q8BY89 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slc44a2Q8BY89 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Slc44a2Q8BY89 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc44a2Q8BY89 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc44a2Q8BY89 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc44a2Q8BY89 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc44a2Q8BY89 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc44a2Q8BY89 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc44a2Q8BY89 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc44a2Q8BY89 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc44a2Q8BY89 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc44a2Q8BY89 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc44a2Q8BY89 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc44a2Q8BY89 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc44a2Q8BY89 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc44a2Q8BY89 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc44a2Q8BY89 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc44a2Q8BY89 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc44a2Q8BY89 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc44a2Q8BY89 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc44a2Q8BY89 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc44a2Q8BY89 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc44a2Q8BY89 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Slc44a2Q8BY89 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc44a2Q8BY89 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc44a2Q8BY89 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc44a2Q8BY89 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc44a2Q8BY89 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc44a2Q8BY89 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc44a2Q8BY89 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc44a2Q8BY89 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc44a2Q8BY89 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc44a2Q8BY89 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms