Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUZ3

Tigd4, Tigger transposable element-derived protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tigd4Q8BUZ3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tigd4Q8BUZ3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tigd4Q8BUZ3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tigd4Q8BUZ3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tigd4Q8BUZ3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Tigd4Q8BUZ3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tigd4Q8BUZ3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tigd4Q8BUZ3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tigd4Q8BUZ3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tigd4Q8BUZ3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tigd4Q8BUZ3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tigd4Q8BUZ3 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tigd4Q8BUZ3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tigd4Q8BUZ3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tigd4Q8BUZ3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tigd4Q8BUZ3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tigd4Q8BUZ3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tigd4Q8BUZ3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tigd4Q8BUZ3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tigd4Q8BUZ3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tigd4Q8BUZ3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tigd4Q8BUZ3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tigd4Q8BUZ3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tigd4Q8BUZ3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tigd4Q8BUZ3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tigd4Q8BUZ3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tigd4Q8BUZ3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Tigd4Q8BUZ3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tigd4Q8BUZ3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tigd4Q8BUZ3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tigd4Q8BUZ3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tigd4Q8BUZ3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tigd4Q8BUZ3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tigd4Q8BUZ3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tigd4Q8BUZ3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tigd4Q8BUZ3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tigd4Q8BUZ3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Tigd4Q8BUZ3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tigd4Q8BUZ3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Tigd4Q8BUZ3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tigd4Q8BUZ3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tigd4Q8BUZ3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tigd4Q8BUZ3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tigd4Q8BUZ3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tigd4Q8BUZ3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tigd4Q8BUZ3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Tigd4Q8BUZ3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tigd4Q8BUZ3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tigd4Q8BUZ3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tigd4Q8BUZ3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tigd4Q8BUZ3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tigd4Q8BUZ3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tigd4Q8BUZ3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tigd4Q8BUZ3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tigd4Q8BUZ3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tigd4Q8BUZ3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tigd4Q8BUZ3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tigd4Q8BUZ3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tigd4Q8BUZ3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tigd4Q8BUZ3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tigd4Q8BUZ3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tigd4Q8BUZ3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tigd4Q8BUZ3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tigd4Q8BUZ3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tigd4Q8BUZ3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tigd4Q8BUZ3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tigd4Q8BUZ3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tigd4Q8BUZ3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tigd4Q8BUZ3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Tigd4Q8BUZ3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tigd4Q8BUZ3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tigd4Q8BUZ3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tigd4Q8BUZ3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tigd4Q8BUZ3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Tigd4Q8BUZ3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tigd4Q8BUZ3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tigd4Q8BUZ3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tigd4Q8BUZ3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Tigd4Q8BUZ3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tigd4Q8BUZ3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tigd4Q8BUZ3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tigd4Q8BUZ3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tigd4Q8BUZ3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tigd4Q8BUZ3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tigd4Q8BUZ3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tigd4Q8BUZ3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tigd4Q8BUZ3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tigd4Q8BUZ3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tigd4Q8BUZ3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tigd4Q8BUZ3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tigd4Q8BUZ3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tigd4Q8BUZ3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tigd4Q8BUZ3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tigd4Q8BUZ3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tigd4Q8BUZ3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tigd4Q8BUZ3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tigd4Q8BUZ3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tigd4Q8BUZ3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tigd4Q8BUZ3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tigd4Q8BUZ3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms