Protein–RNA interactions for Protein: Q8BT88

Uncharacterized protein C16orf90 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BT88 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8BT88 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8BT88 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8BT88 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8BT88 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q8BT88 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q8BT88 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Q8BT88 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q8BT88 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q8BT88 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q8BT88 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Q8BT88 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q8BT88 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q8BT88 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8BT88 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8BT88 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8BT88 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8BT88 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q8BT88 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8BT88 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8BT88 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8BT88 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8BT88 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8BT88 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8BT88 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8BT88 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8BT88 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8BT88 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8BT88 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8BT88 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8BT88 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q8BT88 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q8BT88 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8BT88 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8BT88 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8BT88 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8BT88 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8BT88 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8BT88 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8BT88 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q8BT88 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q8BT88 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q8BT88 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q8BT88 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8BT88 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8BT88 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8BT88 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8BT88 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8BT88 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8BT88 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8BT88 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8BT88 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8BT88 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8BT88 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8BT88 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8BT88 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8BT88 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8BT88 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8BT88 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8BT88 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8BT88 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8BT88 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8BT88 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8BT88 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8BT88 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8BT88 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8BT88 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q8BT88 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q8BT88 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8BT88 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8BT88 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8BT88 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8BT88 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8BT88 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8BT88 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8BT88 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8BT88 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8BT88 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8BT88 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8BT88 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8BT88 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8BT88 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8BT88 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8BT88 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8BT88 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8BT88 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q8BT88 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q8BT88 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q8BT88 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8BT88 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8BT88 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8BT88 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8BT88 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8BT88 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8BT88 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8BT88 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8BT88 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8BT88 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8BT88 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8BT88 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.9 ms