Protein–RNA interactions for Protein: Q8BT35

Smim37, Small integral membrane protein 37, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim37Q8BT35 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smim37Q8BT35 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smim37Q8BT35 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smim37Q8BT35 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smim37Q8BT35 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smim37Q8BT35 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smim37Q8BT35 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smim37Q8BT35 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smim37Q8BT35 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smim37Q8BT35 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Smim37Q8BT35 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smim37Q8BT35 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Smim37Q8BT35 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Smim37Q8BT35 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smim37Q8BT35 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smim37Q8BT35 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smim37Q8BT35 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smim37Q8BT35 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smim37Q8BT35 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smim37Q8BT35 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smim37Q8BT35 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smim37Q8BT35 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smim37Q8BT35 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smim37Q8BT35 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smim37Q8BT35 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smim37Q8BT35 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smim37Q8BT35 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smim37Q8BT35 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smim37Q8BT35 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smim37Q8BT35 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smim37Q8BT35 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Smim37Q8BT35 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Smim37Q8BT35 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smim37Q8BT35 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smim37Q8BT35 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smim37Q8BT35 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smim37Q8BT35 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smim37Q8BT35 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smim37Q8BT35 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smim37Q8BT35 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smim37Q8BT35 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smim37Q8BT35 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smim37Q8BT35 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smim37Q8BT35 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smim37Q8BT35 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smim37Q8BT35 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smim37Q8BT35 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smim37Q8BT35 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Smim37Q8BT35 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smim37Q8BT35 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smim37Q8BT35 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smim37Q8BT35 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smim37Q8BT35 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smim37Q8BT35 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smim37Q8BT35 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Smim37Q8BT35 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Smim37Q8BT35 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smim37Q8BT35 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smim37Q8BT35 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smim37Q8BT35 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smim37Q8BT35 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Smim37Q8BT35 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smim37Q8BT35 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smim37Q8BT35 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smim37Q8BT35 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smim37Q8BT35 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smim37Q8BT35 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smim37Q8BT35 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smim37Q8BT35 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smim37Q8BT35 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smim37Q8BT35 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smim37Q8BT35 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smim37Q8BT35 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smim37Q8BT35 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smim37Q8BT35 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smim37Q8BT35 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smim37Q8BT35 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smim37Q8BT35 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smim37Q8BT35 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smim37Q8BT35 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smim37Q8BT35 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smim37Q8BT35 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smim37Q8BT35 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Smim37Q8BT35 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Smim37Q8BT35 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smim37Q8BT35 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smim37Q8BT35 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smim37Q8BT35 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smim37Q8BT35 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smim37Q8BT35 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smim37Q8BT35 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smim37Q8BT35 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smim37Q8BT35 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smim37Q8BT35 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smim37Q8BT35 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smim37Q8BT35 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smim37Q8BT35 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smim37Q8BT35 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smim37Q8BT35 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smim37Q8BT35 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms