Protein–RNA interactions for Protein: Q8BT14

Cnot4, CCR4-NOT transcription complex subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot4Q8BT14 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cnot4Q8BT14 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cnot4Q8BT14 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cnot4Q8BT14 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cnot4Q8BT14 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cnot4Q8BT14 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cnot4Q8BT14 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cnot4Q8BT14 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cnot4Q8BT14 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cnot4Q8BT14 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cnot4Q8BT14 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cnot4Q8BT14 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cnot4Q8BT14 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cnot4Q8BT14 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cnot4Q8BT14 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Cnot4Q8BT14 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cnot4Q8BT14 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cnot4Q8BT14 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cnot4Q8BT14 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cnot4Q8BT14 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cnot4Q8BT14 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cnot4Q8BT14 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cnot4Q8BT14 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cnot4Q8BT14 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cnot4Q8BT14 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cnot4Q8BT14 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cnot4Q8BT14 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cnot4Q8BT14 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cnot4Q8BT14 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Cnot4Q8BT14 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Cnot4Q8BT14 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cnot4Q8BT14 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cnot4Q8BT14 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cnot4Q8BT14 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cnot4Q8BT14 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cnot4Q8BT14 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cnot4Q8BT14 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cnot4Q8BT14 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cnot4Q8BT14 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cnot4Q8BT14 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cnot4Q8BT14 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cnot4Q8BT14 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cnot4Q8BT14 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cnot4Q8BT14 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cnot4Q8BT14 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cnot4Q8BT14 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cnot4Q8BT14 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cnot4Q8BT14 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cnot4Q8BT14 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Cnot4Q8BT14 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cnot4Q8BT14 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cnot4Q8BT14 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cnot4Q8BT14 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cnot4Q8BT14 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cnot4Q8BT14 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cnot4Q8BT14 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cnot4Q8BT14 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cnot4Q8BT14 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cnot4Q8BT14 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cnot4Q8BT14 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cnot4Q8BT14 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cnot4Q8BT14 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cnot4Q8BT14 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cnot4Q8BT14 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cnot4Q8BT14 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cnot4Q8BT14 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cnot4Q8BT14 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cnot4Q8BT14 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cnot4Q8BT14 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Cnot4Q8BT14 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cnot4Q8BT14 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cnot4Q8BT14 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cnot4Q8BT14 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cnot4Q8BT14 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cnot4Q8BT14 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cnot4Q8BT14 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cnot4Q8BT14 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cnot4Q8BT14 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cnot4Q8BT14 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cnot4Q8BT14 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cnot4Q8BT14 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Cnot4Q8BT14 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cnot4Q8BT14 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cnot4Q8BT14 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cnot4Q8BT14 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cnot4Q8BT14 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cnot4Q8BT14 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cnot4Q8BT14 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cnot4Q8BT14 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cnot4Q8BT14 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cnot4Q8BT14 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Cnot4Q8BT14 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cnot4Q8BT14 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cnot4Q8BT14 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cnot4Q8BT14 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cnot4Q8BT14 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnot4Q8BT14 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnot4Q8BT14 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cnot4Q8BT14 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cnot4Q8BT14 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms