Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Gga3Q8BMI3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Gga3Q8BMI3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
Gga3Q8BMI3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Gga3Q8BMI3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Gga3Q8BMI3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Gga3Q8BMI3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Gga3Q8BMI3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
Gga3Q8BMI3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Gga3Q8BMI3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Gga3Q8BMI3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Gga3Q8BMI3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Gga3Q8BMI3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Gga3Q8BMI3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Gga3Q8BMI3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Gga3Q8BMI3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Gga3Q8BMI3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Gga3Q8BMI3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Gga3Q8BMI3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Gga3Q8BMI3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Gga3Q8BMI3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Gga3Q8BMI3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Gga3Q8BMI3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Gga3Q8BMI3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Gga3Q8BMI3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Gga3Q8BMI3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Gga3Q8BMI3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Gga3Q8BMI3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Gga3Q8BMI3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Gga3Q8BMI3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Gga3Q8BMI3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Gga3Q8BMI3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Gga3Q8BMI3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Gga3Q8BMI3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Gga3Q8BMI3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Gga3Q8BMI3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Gga3Q8BMI3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Gga3Q8BMI3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Gga3Q8BMI3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Gga3Q8BMI3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Gga3Q8BMI3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Gga3Q8BMI3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Gga3Q8BMI3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Gga3Q8BMI3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Gga3Q8BMI3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Gga3Q8BMI3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Gga3Q8BMI3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Gga3Q8BMI3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Gga3Q8BMI3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Gga3Q8BMI3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Gga3Q8BMI3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Gga3Q8BMI3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Gga3Q8BMI3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Gga3Q8BMI3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Gga3Q8BMI3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Gga3Q8BMI3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Gga3Q8BMI3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Gga3Q8BMI3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Gga3Q8BMI3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Gga3Q8BMI3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Gga3Q8BMI3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Gga3Q8BMI3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Gga3Q8BMI3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Gga3Q8BMI3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Gga3Q8BMI3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Gga3Q8BMI3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Gga3Q8BMI3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Gga3Q8BMI3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Gga3Q8BMI3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Gga3Q8BMI3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Gga3Q8BMI3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Gga3Q8BMI3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Gga3Q8BMI3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Gga3Q8BMI3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Gga3Q8BMI3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Gga3Q8BMI3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Gga3Q8BMI3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Gga3Q8BMI3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Gga3Q8BMI3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Gga3Q8BMI3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Gga3Q8BMI3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Gga3Q8BMI3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Gga3Q8BMI3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Gga3Q8BMI3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Gga3Q8BMI3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Gga3Q8BMI3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Gga3Q8BMI3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Gga3Q8BMI3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Gga3Q8BMI3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Gga3Q8BMI3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Gga3Q8BMI3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Gga3Q8BMI3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Gga3Q8BMI3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Gga3Q8BMI3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Gga3Q8BMI3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Gga3Q8BMI3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Gga3Q8BMI3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Gga3Q8BMI3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Gga3Q8BMI3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Gga3Q8BMI3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms