Protein–RNA interactions for Protein: Q8BI36

Jkamp, JNK1/MAPK8-associated membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JkampQ8BI36 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
JkampQ8BI36 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
JkampQ8BI36 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
JkampQ8BI36 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
JkampQ8BI36 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
JkampQ8BI36 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
JkampQ8BI36 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
JkampQ8BI36 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
JkampQ8BI36 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
JkampQ8BI36 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
JkampQ8BI36 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
JkampQ8BI36 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
JkampQ8BI36 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
JkampQ8BI36 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
JkampQ8BI36 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
JkampQ8BI36 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
JkampQ8BI36 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
JkampQ8BI36 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
JkampQ8BI36 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
JkampQ8BI36 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
JkampQ8BI36 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
JkampQ8BI36 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
JkampQ8BI36 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
JkampQ8BI36 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
JkampQ8BI36 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
JkampQ8BI36 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
JkampQ8BI36 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
JkampQ8BI36 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
JkampQ8BI36 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
JkampQ8BI36 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
JkampQ8BI36 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
JkampQ8BI36 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
JkampQ8BI36 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
JkampQ8BI36 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
JkampQ8BI36 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
JkampQ8BI36 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
JkampQ8BI36 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
JkampQ8BI36 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
JkampQ8BI36 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
JkampQ8BI36 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
JkampQ8BI36 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
JkampQ8BI36 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
JkampQ8BI36 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
JkampQ8BI36 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
JkampQ8BI36 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
JkampQ8BI36 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
JkampQ8BI36 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
JkampQ8BI36 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
JkampQ8BI36 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
JkampQ8BI36 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
JkampQ8BI36 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
JkampQ8BI36 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
JkampQ8BI36 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
JkampQ8BI36 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
JkampQ8BI36 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
JkampQ8BI36 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
JkampQ8BI36 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
JkampQ8BI36 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
JkampQ8BI36 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
JkampQ8BI36 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
JkampQ8BI36 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
JkampQ8BI36 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
JkampQ8BI36 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
JkampQ8BI36 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
JkampQ8BI36 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
JkampQ8BI36 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
JkampQ8BI36 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
JkampQ8BI36 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
JkampQ8BI36 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
JkampQ8BI36 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
JkampQ8BI36 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
JkampQ8BI36 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
JkampQ8BI36 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
JkampQ8BI36 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
JkampQ8BI36 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
JkampQ8BI36 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
JkampQ8BI36 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
JkampQ8BI36 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
JkampQ8BI36 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
JkampQ8BI36 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
JkampQ8BI36 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
JkampQ8BI36 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
JkampQ8BI36 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
JkampQ8BI36 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
JkampQ8BI36 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
JkampQ8BI36 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
JkampQ8BI36 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
JkampQ8BI36 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
JkampQ8BI36 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
JkampQ8BI36 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
JkampQ8BI36 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
JkampQ8BI36 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
JkampQ8BI36 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
JkampQ8BI36 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
JkampQ8BI36 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
JkampQ8BI36 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
JkampQ8BI36 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
JkampQ8BI36 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
JkampQ8BI36 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
JkampQ8BI36 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms