Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH15

Cnot10, CCR4-NOT transcription complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot10Q8BH15 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cnot10Q8BH15 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cnot10Q8BH15 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cnot10Q8BH15 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Cnot10Q8BH15 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cnot10Q8BH15 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cnot10Q8BH15 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cnot10Q8BH15 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cnot10Q8BH15 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cnot10Q8BH15 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cnot10Q8BH15 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cnot10Q8BH15 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cnot10Q8BH15 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cnot10Q8BH15 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cnot10Q8BH15 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cnot10Q8BH15 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cnot10Q8BH15 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cnot10Q8BH15 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cnot10Q8BH15 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cnot10Q8BH15 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cnot10Q8BH15 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cnot10Q8BH15 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cnot10Q8BH15 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cnot10Q8BH15 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cnot10Q8BH15 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Cnot10Q8BH15 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cnot10Q8BH15 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cnot10Q8BH15 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cnot10Q8BH15 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Cnot10Q8BH15 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cnot10Q8BH15 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cnot10Q8BH15 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cnot10Q8BH15 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cnot10Q8BH15 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cnot10Q8BH15 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cnot10Q8BH15 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cnot10Q8BH15 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cnot10Q8BH15 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cnot10Q8BH15 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cnot10Q8BH15 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Cnot10Q8BH15 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cnot10Q8BH15 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cnot10Q8BH15 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cnot10Q8BH15 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cnot10Q8BH15 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cnot10Q8BH15 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cnot10Q8BH15 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cnot10Q8BH15 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cnot10Q8BH15 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cnot10Q8BH15 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cnot10Q8BH15 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cnot10Q8BH15 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cnot10Q8BH15 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cnot10Q8BH15 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cnot10Q8BH15 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cnot10Q8BH15 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cnot10Q8BH15 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Cnot10Q8BH15 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cnot10Q8BH15 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cnot10Q8BH15 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cnot10Q8BH15 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cnot10Q8BH15 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cnot10Q8BH15 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cnot10Q8BH15 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cnot10Q8BH15 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cnot10Q8BH15 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cnot10Q8BH15 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cnot10Q8BH15 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cnot10Q8BH15 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cnot10Q8BH15 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cnot10Q8BH15 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cnot10Q8BH15 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cnot10Q8BH15 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cnot10Q8BH15 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cnot10Q8BH15 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cnot10Q8BH15 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Cnot10Q8BH15 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cnot10Q8BH15 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cnot10Q8BH15 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cnot10Q8BH15 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cnot10Q8BH15 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cnot10Q8BH15 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cnot10Q8BH15 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cnot10Q8BH15 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cnot10Q8BH15 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cnot10Q8BH15 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Cnot10Q8BH15 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cnot10Q8BH15 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cnot10Q8BH15 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cnot10Q8BH15 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cnot10Q8BH15 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cnot10Q8BH15 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cnot10Q8BH15 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cnot10Q8BH15 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cnot10Q8BH15 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cnot10Q8BH15 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cnot10Q8BH15 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cnot10Q8BH15 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cnot10Q8BH15 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cnot10Q8BH15 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms