Protein–RNA interactions for Protein: Q810M6

Liat1, Protein LIAT1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Liat1Q810M6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Liat1Q810M6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Liat1Q810M6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
Liat1Q810M6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Liat1Q810M6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Liat1Q810M6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Liat1Q810M6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Liat1Q810M6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Liat1Q810M6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Liat1Q810M6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Liat1Q810M6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Liat1Q810M6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Liat1Q810M6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Liat1Q810M6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Liat1Q810M6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Liat1Q810M6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Liat1Q810M6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Liat1Q810M6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Liat1Q810M6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Liat1Q810M6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
Liat1Q810M6 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Liat1Q810M6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Liat1Q810M6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Liat1Q810M6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Liat1Q810M6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Liat1Q810M6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Liat1Q810M6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Liat1Q810M6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Liat1Q810M6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Liat1Q810M6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Liat1Q810M6 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Liat1Q810M6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Liat1Q810M6 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Liat1Q810M6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Liat1Q810M6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Liat1Q810M6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Liat1Q810M6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Liat1Q810M6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Liat1Q810M6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Liat1Q810M6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Liat1Q810M6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Liat1Q810M6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Liat1Q810M6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Liat1Q810M6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Liat1Q810M6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Liat1Q810M6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Liat1Q810M6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Liat1Q810M6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Liat1Q810M6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Liat1Q810M6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Liat1Q810M6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Liat1Q810M6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Liat1Q810M6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Liat1Q810M6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Liat1Q810M6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Liat1Q810M6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Liat1Q810M6 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Liat1Q810M6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Liat1Q810M6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Liat1Q810M6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Liat1Q810M6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Liat1Q810M6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Liat1Q810M6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Liat1Q810M6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Liat1Q810M6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Liat1Q810M6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Liat1Q810M6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
Liat1Q810M6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Liat1Q810M6 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Liat1Q810M6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Liat1Q810M6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Liat1Q810M6 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Liat1Q810M6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Liat1Q810M6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Liat1Q810M6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Liat1Q810M6 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC31.9■■■□□ 2.7
Liat1Q810M6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Liat1Q810M6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Liat1Q810M6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Liat1Q810M6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Liat1Q810M6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
Liat1Q810M6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Liat1Q810M6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Liat1Q810M6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Liat1Q810M6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Liat1Q810M6 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Liat1Q810M6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Liat1Q810M6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Liat1Q810M6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Liat1Q810M6 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
Liat1Q810M6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Liat1Q810M6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Liat1Q810M6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
Liat1Q810M6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Liat1Q810M6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Liat1Q810M6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Liat1Q810M6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Liat1Q810M6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Liat1Q810M6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Liat1Q810M6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms