Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU5

Ccdc181, Coiled-coil domain-containing protein 181, mousemouse

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc181Q80ZU5 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc181Q80ZU5 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc181Q80ZU5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc181Q80ZU5 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc181Q80ZU5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc181Q80ZU5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc181Q80ZU5 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc181Q80ZU5 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc181Q80ZU5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc181Q80ZU5 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc181Q80ZU5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc181Q80ZU5 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc181Q80ZU5 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc181Q80ZU5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc181Q80ZU5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc181Q80ZU5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc181Q80ZU5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc181Q80ZU5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc181Q80ZU5 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc181Q80ZU5 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc181Q80ZU5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc181Q80ZU5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc181Q80ZU5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc181Q80ZU5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc181Q80ZU5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc181Q80ZU5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc181Q80ZU5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc181Q80ZU5 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc181Q80ZU5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc181Q80ZU5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc181Q80ZU5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc181Q80ZU5 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc181Q80ZU5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc181Q80ZU5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc181Q80ZU5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc181Q80ZU5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc181Q80ZU5 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc181Q80ZU5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc181Q80ZU5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc181Q80ZU5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc181Q80ZU5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc181Q80ZU5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc181Q80ZU5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc181Q80ZU5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc181Q80ZU5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccdc181Q80ZU5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc181Q80ZU5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc181Q80ZU5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc181Q80ZU5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc181Q80ZU5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc181Q80ZU5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Ccdc181Q80ZU5 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc181Q80ZU5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc181Q80ZU5 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc181Q80ZU5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc181Q80ZU5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc181Q80ZU5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc181Q80ZU5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc181Q80ZU5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc181Q80ZU5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc181Q80ZU5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc181Q80ZU5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc181Q80ZU5 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc181Q80ZU5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc181Q80ZU5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc181Q80ZU5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc181Q80ZU5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc181Q80ZU5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc181Q80ZU5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc181Q80ZU5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc181Q80ZU5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc181Q80ZU5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccdc181Q80ZU5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ccdc181Q80ZU5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc181Q80ZU5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc181Q80ZU5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc181Q80ZU5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc181Q80ZU5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc181Q80ZU5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc181Q80ZU5 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc181Q80ZU5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc181Q80ZU5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc181Q80ZU5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc181Q80ZU5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc181Q80ZU5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc181Q80ZU5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc181Q80ZU5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc181Q80ZU5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Ccdc181Q80ZU5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc181Q80ZU5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc181Q80ZU5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc181Q80ZU5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc181Q80ZU5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc181Q80ZU5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc181Q80ZU5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc181Q80ZU5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc181Q80ZU5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc181Q80ZU5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc181Q80ZU5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc181Q80ZU5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms