Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM8

Pnma8a, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma8aQ80VM8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pnma8aQ80VM8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pnma8aQ80VM8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pnma8aQ80VM8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pnma8aQ80VM8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pnma8aQ80VM8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pnma8aQ80VM8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pnma8aQ80VM8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pnma8aQ80VM8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Pnma8aQ80VM8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pnma8aQ80VM8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pnma8aQ80VM8 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pnma8aQ80VM8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pnma8aQ80VM8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pnma8aQ80VM8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pnma8aQ80VM8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pnma8aQ80VM8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pnma8aQ80VM8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pnma8aQ80VM8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pnma8aQ80VM8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pnma8aQ80VM8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pnma8aQ80VM8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pnma8aQ80VM8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pnma8aQ80VM8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Pnma8aQ80VM8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pnma8aQ80VM8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pnma8aQ80VM8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pnma8aQ80VM8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pnma8aQ80VM8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pnma8aQ80VM8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Pnma8aQ80VM8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Pnma8aQ80VM8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pnma8aQ80VM8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pnma8aQ80VM8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pnma8aQ80VM8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Pnma8aQ80VM8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pnma8aQ80VM8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pnma8aQ80VM8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pnma8aQ80VM8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Pnma8aQ80VM8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pnma8aQ80VM8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pnma8aQ80VM8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pnma8aQ80VM8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pnma8aQ80VM8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pnma8aQ80VM8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pnma8aQ80VM8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pnma8aQ80VM8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pnma8aQ80VM8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pnma8aQ80VM8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pnma8aQ80VM8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pnma8aQ80VM8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pnma8aQ80VM8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pnma8aQ80VM8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pnma8aQ80VM8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pnma8aQ80VM8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pnma8aQ80VM8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pnma8aQ80VM8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pnma8aQ80VM8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pnma8aQ80VM8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pnma8aQ80VM8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pnma8aQ80VM8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pnma8aQ80VM8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pnma8aQ80VM8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Pnma8aQ80VM8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pnma8aQ80VM8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pnma8aQ80VM8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pnma8aQ80VM8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pnma8aQ80VM8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pnma8aQ80VM8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pnma8aQ80VM8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pnma8aQ80VM8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pnma8aQ80VM8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pnma8aQ80VM8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pnma8aQ80VM8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pnma8aQ80VM8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pnma8aQ80VM8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pnma8aQ80VM8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pnma8aQ80VM8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pnma8aQ80VM8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pnma8aQ80VM8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pnma8aQ80VM8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pnma8aQ80VM8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pnma8aQ80VM8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Pnma8aQ80VM8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pnma8aQ80VM8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pnma8aQ80VM8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pnma8aQ80VM8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pnma8aQ80VM8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pnma8aQ80VM8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Pnma8aQ80VM8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pnma8aQ80VM8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pnma8aQ80VM8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pnma8aQ80VM8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pnma8aQ80VM8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pnma8aQ80VM8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pnma8aQ80VM8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pnma8aQ80VM8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pnma8aQ80VM8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pnma8aQ80VM8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pnma8aQ80VM8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
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