Protein–RNA interactions for Protein: Q80UY2

Kcmf1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcmf1Q80UY2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kcmf1Q80UY2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kcmf1Q80UY2 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kcmf1Q80UY2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kcmf1Q80UY2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kcmf1Q80UY2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Kcmf1Q80UY2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Kcmf1Q80UY2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kcmf1Q80UY2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kcmf1Q80UY2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kcmf1Q80UY2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Kcmf1Q80UY2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Kcmf1Q80UY2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Kcmf1Q80UY2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Kcmf1Q80UY2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kcmf1Q80UY2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Kcmf1Q80UY2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Kcmf1Q80UY2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Kcmf1Q80UY2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Kcmf1Q80UY2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Kcmf1Q80UY2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Kcmf1Q80UY2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kcmf1Q80UY2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kcmf1Q80UY2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kcmf1Q80UY2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kcmf1Q80UY2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kcmf1Q80UY2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Kcmf1Q80UY2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kcmf1Q80UY2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kcmf1Q80UY2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kcmf1Q80UY2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kcmf1Q80UY2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Kcmf1Q80UY2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kcmf1Q80UY2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kcmf1Q80UY2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kcmf1Q80UY2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kcmf1Q80UY2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kcmf1Q80UY2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kcmf1Q80UY2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kcmf1Q80UY2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kcmf1Q80UY2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kcmf1Q80UY2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kcmf1Q80UY2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kcmf1Q80UY2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kcmf1Q80UY2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kcmf1Q80UY2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kcmf1Q80UY2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kcmf1Q80UY2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kcmf1Q80UY2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kcmf1Q80UY2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kcmf1Q80UY2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kcmf1Q80UY2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kcmf1Q80UY2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kcmf1Q80UY2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kcmf1Q80UY2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kcmf1Q80UY2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kcmf1Q80UY2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kcmf1Q80UY2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kcmf1Q80UY2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kcmf1Q80UY2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kcmf1Q80UY2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kcmf1Q80UY2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kcmf1Q80UY2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kcmf1Q80UY2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kcmf1Q80UY2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kcmf1Q80UY2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kcmf1Q80UY2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kcmf1Q80UY2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kcmf1Q80UY2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kcmf1Q80UY2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Kcmf1Q80UY2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Kcmf1Q80UY2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Kcmf1Q80UY2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Kcmf1Q80UY2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Kcmf1Q80UY2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Kcmf1Q80UY2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Kcmf1Q80UY2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Kcmf1Q80UY2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Kcmf1Q80UY2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Kcmf1Q80UY2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Kcmf1Q80UY2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Kcmf1Q80UY2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Kcmf1Q80UY2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Kcmf1Q80UY2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Kcmf1Q80UY2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Kcmf1Q80UY2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kcmf1Q80UY2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kcmf1Q80UY2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kcmf1Q80UY2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kcmf1Q80UY2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Kcmf1Q80UY2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Kcmf1Q80UY2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kcmf1Q80UY2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kcmf1Q80UY2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kcmf1Q80UY2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kcmf1Q80UY2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kcmf1Q80UY2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kcmf1Q80UY2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kcmf1Q80UY2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kcmf1Q80UY2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms